Protein–RNA interactions for Protein: Q6X9E4

FBXW12, F-box/WD repeat-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW12Q6X9E4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FBXW12Q6X9E4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FBXW12Q6X9E4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FBXW12Q6X9E4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FBXW12Q6X9E4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FBXW12Q6X9E4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FBXW12Q6X9E4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FBXW12Q6X9E4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FBXW12Q6X9E4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FBXW12Q6X9E4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FBXW12Q6X9E4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FBXW12Q6X9E4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FBXW12Q6X9E4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FBXW12Q6X9E4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FBXW12Q6X9E4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FBXW12Q6X9E4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FBXW12Q6X9E4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FBXW12Q6X9E4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FBXW12Q6X9E4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FBXW12Q6X9E4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FBXW12Q6X9E4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FBXW12Q6X9E4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FBXW12Q6X9E4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FBXW12Q6X9E4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FBXW12Q6X9E4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXW12Q6X9E4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXW12Q6X9E4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXW12Q6X9E4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXW12Q6X9E4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXW12Q6X9E4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXW12Q6X9E4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXW12Q6X9E4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXW12Q6X9E4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXW12Q6X9E4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXW12Q6X9E4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXW12Q6X9E4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXW12Q6X9E4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXW12Q6X9E4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXW12Q6X9E4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXW12Q6X9E4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXW12Q6X9E4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXW12Q6X9E4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXW12Q6X9E4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXW12Q6X9E4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXW12Q6X9E4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXW12Q6X9E4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXW12Q6X9E4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXW12Q6X9E4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXW12Q6X9E4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXW12Q6X9E4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXW12Q6X9E4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXW12Q6X9E4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXW12Q6X9E4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXW12Q6X9E4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXW12Q6X9E4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXW12Q6X9E4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXW12Q6X9E4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXW12Q6X9E4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXW12Q6X9E4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXW12Q6X9E4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXW12Q6X9E4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXW12Q6X9E4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXW12Q6X9E4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXW12Q6X9E4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXW12Q6X9E4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXW12Q6X9E4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXW12Q6X9E4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXW12Q6X9E4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXW12Q6X9E4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXW12Q6X9E4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXW12Q6X9E4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXW12Q6X9E4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXW12Q6X9E4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXW12Q6X9E4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXW12Q6X9E4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXW12Q6X9E4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXW12Q6X9E4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FBXW12Q6X9E4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXW12Q6X9E4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXW12Q6X9E4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXW12Q6X9E4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXW12Q6X9E4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXW12Q6X9E4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXW12Q6X9E4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXW12Q6X9E4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXW12Q6X9E4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXW12Q6X9E4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXW12Q6X9E4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXW12Q6X9E4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXW12Q6X9E4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXW12Q6X9E4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXW12Q6X9E4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXW12Q6X9E4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXW12Q6X9E4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXW12Q6X9E4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXW12Q6X9E4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXW12Q6X9E4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXW12Q6X9E4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXW12Q6X9E4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXW12Q6X9E4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms