Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VITQ6UXI7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VITQ6UXI7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VITQ6UXI7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VITQ6UXI7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VITQ6UXI7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VITQ6UXI7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VITQ6UXI7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
VITQ6UXI7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VITQ6UXI7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VITQ6UXI7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VITQ6UXI7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VITQ6UXI7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VITQ6UXI7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VITQ6UXI7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VITQ6UXI7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VITQ6UXI7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VITQ6UXI7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VITQ6UXI7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VITQ6UXI7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VITQ6UXI7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
VITQ6UXI7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VITQ6UXI7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VITQ6UXI7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VITQ6UXI7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VITQ6UXI7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VITQ6UXI7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VITQ6UXI7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VITQ6UXI7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
VITQ6UXI7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VITQ6UXI7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VITQ6UXI7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VITQ6UXI7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VITQ6UXI7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VITQ6UXI7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VITQ6UXI7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VITQ6UXI7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VITQ6UXI7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VITQ6UXI7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VITQ6UXI7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VITQ6UXI7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VITQ6UXI7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VITQ6UXI7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VITQ6UXI7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VITQ6UXI7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VITQ6UXI7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VITQ6UXI7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VITQ6UXI7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VITQ6UXI7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VITQ6UXI7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VITQ6UXI7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VITQ6UXI7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VITQ6UXI7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VITQ6UXI7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VITQ6UXI7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VITQ6UXI7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VITQ6UXI7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VITQ6UXI7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VITQ6UXI7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VITQ6UXI7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
VITQ6UXI7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VITQ6UXI7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VITQ6UXI7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VITQ6UXI7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VITQ6UXI7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VITQ6UXI7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VITQ6UXI7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VITQ6UXI7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VITQ6UXI7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VITQ6UXI7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VITQ6UXI7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VITQ6UXI7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VITQ6UXI7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VITQ6UXI7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VITQ6UXI7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VITQ6UXI7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
VITQ6UXI7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VITQ6UXI7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VITQ6UXI7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VITQ6UXI7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VITQ6UXI7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
VITQ6UXI7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VITQ6UXI7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VITQ6UXI7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VITQ6UXI7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VITQ6UXI7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VITQ6UXI7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
VITQ6UXI7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VITQ6UXI7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
VITQ6UXI7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VITQ6UXI7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VITQ6UXI7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VITQ6UXI7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VITQ6UXI7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
VITQ6UXI7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VITQ6UXI7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VITQ6UXI7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
VITQ6UXI7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
VITQ6UXI7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VITQ6UXI7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113 ms