Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms