Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW10

SFTA2, Surfactant-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA2Q6UW10 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFTA2Q6UW10 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTA2Q6UW10 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTA2Q6UW10 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTA2Q6UW10 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTA2Q6UW10 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTA2Q6UW10 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTA2Q6UW10 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTA2Q6UW10 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTA2Q6UW10 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTA2Q6UW10 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTA2Q6UW10 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTA2Q6UW10 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTA2Q6UW10 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTA2Q6UW10 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTA2Q6UW10 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTA2Q6UW10 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTA2Q6UW10 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTA2Q6UW10 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTA2Q6UW10 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTA2Q6UW10 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTA2Q6UW10 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTA2Q6UW10 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTA2Q6UW10 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTA2Q6UW10 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTA2Q6UW10 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTA2Q6UW10 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTA2Q6UW10 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTA2Q6UW10 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTA2Q6UW10 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTA2Q6UW10 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTA2Q6UW10 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTA2Q6UW10 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTA2Q6UW10 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms