Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMARCD3Q6STE5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMARCD3Q6STE5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMARCD3Q6STE5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCD3Q6STE5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCD3Q6STE5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCD3Q6STE5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCD3Q6STE5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCD3Q6STE5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCD3Q6STE5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCD3Q6STE5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCD3Q6STE5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCD3Q6STE5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCD3Q6STE5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMARCD3Q6STE5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMARCD3Q6STE5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMARCD3Q6STE5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMARCD3Q6STE5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMARCD3Q6STE5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMARCD3Q6STE5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SMARCD3Q6STE5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCD3Q6STE5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCD3Q6STE5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCD3Q6STE5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCD3Q6STE5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCD3Q6STE5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCD3Q6STE5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCD3Q6STE5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMARCD3Q6STE5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMARCD3Q6STE5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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