Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHR2

ULK3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK3Q6PHR2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ULK3Q6PHR2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ULK3Q6PHR2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ULK3Q6PHR2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ULK3Q6PHR2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ULK3Q6PHR2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ULK3Q6PHR2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ULK3Q6PHR2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ULK3Q6PHR2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ULK3Q6PHR2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ULK3Q6PHR2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ULK3Q6PHR2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ULK3Q6PHR2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ULK3Q6PHR2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ULK3Q6PHR2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ULK3Q6PHR2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ULK3Q6PHR2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ULK3Q6PHR2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ULK3Q6PHR2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ULK3Q6PHR2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ULK3Q6PHR2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ULK3Q6PHR2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ULK3Q6PHR2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ULK3Q6PHR2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ULK3Q6PHR2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ULK3Q6PHR2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ULK3Q6PHR2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ULK3Q6PHR2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ULK3Q6PHR2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ULK3Q6PHR2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ULK3Q6PHR2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ULK3Q6PHR2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ULK3Q6PHR2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ULK3Q6PHR2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ULK3Q6PHR2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ULK3Q6PHR2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ULK3Q6PHR2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ULK3Q6PHR2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ULK3Q6PHR2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ULK3Q6PHR2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ULK3Q6PHR2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ULK3Q6PHR2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ULK3Q6PHR2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ULK3Q6PHR2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ULK3Q6PHR2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ULK3Q6PHR2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ULK3Q6PHR2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ULK3Q6PHR2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ULK3Q6PHR2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ULK3Q6PHR2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ULK3Q6PHR2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ULK3Q6PHR2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ULK3Q6PHR2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ULK3Q6PHR2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ULK3Q6PHR2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ULK3Q6PHR2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ULK3Q6PHR2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ULK3Q6PHR2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ULK3Q6PHR2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ULK3Q6PHR2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ULK3Q6PHR2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 195.5 ms