Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTR9Q6PD62 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTR9Q6PD62 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTR9Q6PD62 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTR9Q6PD62 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTR9Q6PD62 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTR9Q6PD62 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTR9Q6PD62 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTR9Q6PD62 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTR9Q6PD62 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTR9Q6PD62 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTR9Q6PD62 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTR9Q6PD62 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTR9Q6PD62 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CTR9Q6PD62 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTR9Q6PD62 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTR9Q6PD62 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTR9Q6PD62 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTR9Q6PD62 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTR9Q6PD62 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTR9Q6PD62 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTR9Q6PD62 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTR9Q6PD62 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CTR9Q6PD62 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CTR9Q6PD62 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTR9Q6PD62 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTR9Q6PD62 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTR9Q6PD62 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTR9Q6PD62 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTR9Q6PD62 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTR9Q6PD62 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CTR9Q6PD62 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTR9Q6PD62 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTR9Q6PD62 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTR9Q6PD62 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTR9Q6PD62 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTR9Q6PD62 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTR9Q6PD62 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTR9Q6PD62 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTR9Q6PD62 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTR9Q6PD62 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTR9Q6PD62 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTR9Q6PD62 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTR9Q6PD62 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTR9Q6PD62 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTR9Q6PD62 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTR9Q6PD62 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTR9Q6PD62 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CTR9Q6PD62 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTR9Q6PD62 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTR9Q6PD62 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTR9Q6PD62 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTR9Q6PD62 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTR9Q6PD62 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTR9Q6PD62 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTR9Q6PD62 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTR9Q6PD62 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTR9Q6PD62 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTR9Q6PD62 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTR9Q6PD62 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTR9Q6PD62 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CTR9Q6PD62 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CTR9Q6PD62 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTR9Q6PD62 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTR9Q6PD62 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTR9Q6PD62 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTR9Q6PD62 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTR9Q6PD62 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTR9Q6PD62 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTR9Q6PD62 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTR9Q6PD62 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTR9Q6PD62 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTR9Q6PD62 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTR9Q6PD62 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTR9Q6PD62 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTR9Q6PD62 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTR9Q6PD62 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTR9Q6PD62 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CTR9Q6PD62 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CTR9Q6PD62 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CTR9Q6PD62 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CTR9Q6PD62 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CTR9Q6PD62 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CTR9Q6PD62 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTR9Q6PD62 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTR9Q6PD62 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTR9Q6PD62 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTR9Q6PD62 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTR9Q6PD62 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTR9Q6PD62 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTR9Q6PD62 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTR9Q6PD62 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTR9Q6PD62 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTR9Q6PD62 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTR9Q6PD62 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTR9Q6PD62 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTR9Q6PD62 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTR9Q6PD62 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTR9Q6PD62 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTR9Q6PD62 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms