Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5X5

C22orf39, UPF0545 protein C22orf39, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C22orf39Q6P5X5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C22orf39Q6P5X5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C22orf39Q6P5X5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C22orf39Q6P5X5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C22orf39Q6P5X5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C22orf39Q6P5X5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C22orf39Q6P5X5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C22orf39Q6P5X5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C22orf39Q6P5X5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C22orf39Q6P5X5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C22orf39Q6P5X5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
C22orf39Q6P5X5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
C22orf39Q6P5X5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C22orf39Q6P5X5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C22orf39Q6P5X5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C22orf39Q6P5X5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C22orf39Q6P5X5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
C22orf39Q6P5X5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C22orf39Q6P5X5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C22orf39Q6P5X5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C22orf39Q6P5X5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C22orf39Q6P5X5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C22orf39Q6P5X5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms