Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3S6

FBXO42, F-box only protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO42Q6P3S6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO42Q6P3S6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO42Q6P3S6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO42Q6P3S6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO42Q6P3S6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO42Q6P3S6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO42Q6P3S6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO42Q6P3S6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO42Q6P3S6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO42Q6P3S6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FBXO42Q6P3S6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FBXO42Q6P3S6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FBXO42Q6P3S6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO42Q6P3S6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO42Q6P3S6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO42Q6P3S6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO42Q6P3S6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO42Q6P3S6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO42Q6P3S6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO42Q6P3S6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO42Q6P3S6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO42Q6P3S6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO42Q6P3S6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO42Q6P3S6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO42Q6P3S6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO42Q6P3S6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO42Q6P3S6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO42Q6P3S6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO42Q6P3S6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO42Q6P3S6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO42Q6P3S6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO42Q6P3S6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO42Q6P3S6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO42Q6P3S6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO42Q6P3S6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO42Q6P3S6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO42Q6P3S6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO42Q6P3S6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO42Q6P3S6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO42Q6P3S6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO42Q6P3S6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO42Q6P3S6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO42Q6P3S6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO42Q6P3S6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO42Q6P3S6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO42Q6P3S6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO42Q6P3S6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO42Q6P3S6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO42Q6P3S6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO42Q6P3S6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO42Q6P3S6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO42Q6P3S6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO42Q6P3S6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO42Q6P3S6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO42Q6P3S6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO42Q6P3S6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO42Q6P3S6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO42Q6P3S6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO42Q6P3S6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO42Q6P3S6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO42Q6P3S6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO42Q6P3S6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO42Q6P3S6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FBXO42Q6P3S6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FBXO42Q6P3S6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FBXO42Q6P3S6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO42Q6P3S6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO42Q6P3S6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO42Q6P3S6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO42Q6P3S6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO42Q6P3S6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO42Q6P3S6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO42Q6P3S6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO42Q6P3S6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO42Q6P3S6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO42Q6P3S6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO42Q6P3S6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO42Q6P3S6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO42Q6P3S6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO42Q6P3S6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO42Q6P3S6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO42Q6P3S6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO42Q6P3S6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO42Q6P3S6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO42Q6P3S6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO42Q6P3S6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO42Q6P3S6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO42Q6P3S6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO42Q6P3S6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO42Q6P3S6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO42Q6P3S6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO42Q6P3S6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO42Q6P3S6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO42Q6P3S6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO42Q6P3S6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO42Q6P3S6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO42Q6P3S6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO42Q6P3S6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO42Q6P3S6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO42Q6P3S6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms