Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3R8

NEK5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK5Q6P3R8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEK5Q6P3R8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEK5Q6P3R8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEK5Q6P3R8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEK5Q6P3R8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEK5Q6P3R8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEK5Q6P3R8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEK5Q6P3R8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEK5Q6P3R8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEK5Q6P3R8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEK5Q6P3R8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEK5Q6P3R8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEK5Q6P3R8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEK5Q6P3R8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEK5Q6P3R8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEK5Q6P3R8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEK5Q6P3R8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEK5Q6P3R8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEK5Q6P3R8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEK5Q6P3R8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NEK5Q6P3R8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NEK5Q6P3R8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEK5Q6P3R8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEK5Q6P3R8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NEK5Q6P3R8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEK5Q6P3R8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEK5Q6P3R8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEK5Q6P3R8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEK5Q6P3R8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEK5Q6P3R8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEK5Q6P3R8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEK5Q6P3R8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEK5Q6P3R8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEK5Q6P3R8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEK5Q6P3R8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEK5Q6P3R8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEK5Q6P3R8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEK5Q6P3R8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEK5Q6P3R8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEK5Q6P3R8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEK5Q6P3R8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEK5Q6P3R8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEK5Q6P3R8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEK5Q6P3R8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEK5Q6P3R8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEK5Q6P3R8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEK5Q6P3R8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEK5Q6P3R8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEK5Q6P3R8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEK5Q6P3R8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NEK5Q6P3R8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEK5Q6P3R8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEK5Q6P3R8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEK5Q6P3R8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEK5Q6P3R8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEK5Q6P3R8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEK5Q6P3R8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEK5Q6P3R8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEK5Q6P3R8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEK5Q6P3R8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEK5Q6P3R8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEK5Q6P3R8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NEK5Q6P3R8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEK5Q6P3R8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEK5Q6P3R8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEK5Q6P3R8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEK5Q6P3R8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEK5Q6P3R8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEK5Q6P3R8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEK5Q6P3R8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEK5Q6P3R8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEK5Q6P3R8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEK5Q6P3R8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NEK5Q6P3R8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEK5Q6P3R8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEK5Q6P3R8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEK5Q6P3R8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEK5Q6P3R8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NEK5Q6P3R8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NEK5Q6P3R8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEK5Q6P3R8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEK5Q6P3R8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEK5Q6P3R8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEK5Q6P3R8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEK5Q6P3R8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEK5Q6P3R8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEK5Q6P3R8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEK5Q6P3R8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEK5Q6P3R8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEK5Q6P3R8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEK5Q6P3R8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEK5Q6P3R8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEK5Q6P3R8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEK5Q6P3R8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEK5Q6P3R8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEK5Q6P3R8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEK5Q6P3R8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEK5Q6P3R8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEK5Q6P3R8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEK5Q6P3R8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms