Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1X6

C8orf82, UPF0598 protein C8orf82, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf82Q6P1X6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C8orf82Q6P1X6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C8orf82Q6P1X6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C8orf82Q6P1X6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf82Q6P1X6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf82Q6P1X6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf82Q6P1X6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf82Q6P1X6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf82Q6P1X6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf82Q6P1X6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf82Q6P1X6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf82Q6P1X6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C8orf82Q6P1X6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C8orf82Q6P1X6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C8orf82Q6P1X6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C8orf82Q6P1X6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C8orf82Q6P1X6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C8orf82Q6P1X6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C8orf82Q6P1X6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C8orf82Q6P1X6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C8orf82Q6P1X6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C8orf82Q6P1X6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C8orf82Q6P1X6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C8orf82Q6P1X6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C8orf82Q6P1X6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C8orf82Q6P1X6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C8orf82Q6P1X6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8orf82Q6P1X6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8orf82Q6P1X6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8orf82Q6P1X6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8orf82Q6P1X6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8orf82Q6P1X6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8orf82Q6P1X6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8orf82Q6P1X6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf82Q6P1X6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf82Q6P1X6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf82Q6P1X6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf82Q6P1X6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf82Q6P1X6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf82Q6P1X6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf82Q6P1X6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf82Q6P1X6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf82Q6P1X6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf82Q6P1X6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf82Q6P1X6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C8orf82Q6P1X6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C8orf82Q6P1X6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C8orf82Q6P1X6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms