Protein–RNA interactions for Protein: Q6AWC8

Putative uncharacterized protein LOC100129027, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6AWC8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q6AWC8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q6AWC8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q6AWC8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q6AWC8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q6AWC8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q6AWC8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q6AWC8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q6AWC8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q6AWC8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q6AWC8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q6AWC8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q6AWC8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q6AWC8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q6AWC8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6AWC8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6AWC8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6AWC8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6AWC8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6AWC8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6AWC8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6AWC8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6AWC8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6AWC8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6AWC8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6AWC8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6AWC8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6AWC8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6AWC8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6AWC8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6AWC8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6AWC8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6AWC8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6AWC8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6AWC8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6AWC8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6AWC8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6AWC8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6AWC8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6AWC8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6AWC8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6AWC8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6AWC8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6AWC8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6AWC8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6AWC8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6AWC8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6AWC8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6AWC8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6AWC8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6AWC8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6AWC8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6AWC8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6AWC8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6AWC8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6AWC8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6AWC8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6AWC8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6AWC8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6AWC8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6AWC8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6AWC8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6AWC8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6AWC8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6AWC8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6AWC8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6AWC8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6AWC8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6AWC8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6AWC8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6AWC8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6AWC8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6AWC8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6AWC8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6AWC8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6AWC8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6AWC8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6AWC8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6AWC8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6AWC8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6AWC8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6AWC8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q6AWC8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q6AWC8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q6AWC8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q6AWC8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q6AWC8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q6AWC8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q6AWC8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q6AWC8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q6AWC8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6AWC8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6AWC8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6AWC8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6AWC8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6AWC8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6AWC8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6AWC8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6AWC8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6AWC8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms