Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC9A4Q6AI14 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC9A4Q6AI14 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC9A4Q6AI14 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC9A4Q6AI14 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC9A4Q6AI14 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC9A4Q6AI14 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC9A4Q6AI14 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC9A4Q6AI14 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC9A4Q6AI14 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC9A4Q6AI14 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC9A4Q6AI14 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC9A4Q6AI14 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC9A4Q6AI14 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC9A4Q6AI14 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC9A4Q6AI14 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC9A4Q6AI14 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC9A4Q6AI14 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC9A4Q6AI14 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC9A4Q6AI14 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC9A4Q6AI14 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC9A4Q6AI14 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC9A4Q6AI14 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC9A4Q6AI14 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC9A4Q6AI14 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC9A4Q6AI14 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC9A4Q6AI14 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC9A4Q6AI14 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC9A4Q6AI14 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC9A4Q6AI14 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC9A4Q6AI14 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC9A4Q6AI14 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC9A4Q6AI14 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC9A4Q6AI14 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC9A4Q6AI14 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC9A4Q6AI14 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC9A4Q6AI14 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC9A4Q6AI14 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC9A4Q6AI14 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC9A4Q6AI14 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC9A4Q6AI14 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC9A4Q6AI14 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC9A4Q6AI14 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC9A4Q6AI14 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC9A4Q6AI14 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC9A4Q6AI14 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC9A4Q6AI14 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC9A4Q6AI14 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC9A4Q6AI14 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC9A4Q6AI14 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC9A4Q6AI14 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC9A4Q6AI14 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC9A4Q6AI14 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC9A4Q6AI14 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC9A4Q6AI14 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC9A4Q6AI14 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC9A4Q6AI14 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC9A4Q6AI14 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC9A4Q6AI14 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC9A4Q6AI14 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC9A4Q6AI14 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC9A4Q6AI14 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC9A4Q6AI14 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC9A4Q6AI14 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC9A4Q6AI14 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC9A4Q6AI14 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC9A4Q6AI14 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC9A4Q6AI14 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC9A4Q6AI14 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC9A4Q6AI14 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC9A4Q6AI14 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC9A4Q6AI14 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC9A4Q6AI14 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC9A4Q6AI14 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC9A4Q6AI14 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC9A4Q6AI14 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC9A4Q6AI14 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC9A4Q6AI14 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC9A4Q6AI14 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC9A4Q6AI14 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC9A4Q6AI14 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC9A4Q6AI14 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC9A4Q6AI14 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC9A4Q6AI14 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC9A4Q6AI14 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC9A4Q6AI14 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC9A4Q6AI14 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC9A4Q6AI14 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC9A4Q6AI14 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC9A4Q6AI14 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC9A4Q6AI14 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC9A4Q6AI14 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC9A4Q6AI14 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC9A4Q6AI14 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC9A4Q6AI14 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC9A4Q6AI14 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC9A4Q6AI14 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC9A4Q6AI14 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC9A4Q6AI14 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC9A4Q6AI14 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms