Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPECC1LQ69YQ0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPECC1LQ69YQ0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPECC1LQ69YQ0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPECC1LQ69YQ0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPECC1LQ69YQ0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPECC1LQ69YQ0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPECC1LQ69YQ0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPECC1LQ69YQ0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPECC1LQ69YQ0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPECC1LQ69YQ0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPECC1LQ69YQ0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPECC1LQ69YQ0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPECC1LQ69YQ0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPECC1LQ69YQ0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPECC1LQ69YQ0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPECC1LQ69YQ0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPECC1LQ69YQ0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPECC1LQ69YQ0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPECC1LQ69YQ0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPECC1LQ69YQ0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPECC1LQ69YQ0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPECC1LQ69YQ0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPECC1LQ69YQ0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPECC1LQ69YQ0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPECC1LQ69YQ0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPECC1LQ69YQ0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPECC1LQ69YQ0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPECC1LQ69YQ0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPECC1LQ69YQ0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPECC1LQ69YQ0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPECC1LQ69YQ0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SPECC1LQ69YQ0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPECC1LQ69YQ0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPECC1LQ69YQ0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPECC1LQ69YQ0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPECC1LQ69YQ0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPECC1LQ69YQ0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SPECC1LQ69YQ0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPECC1LQ69YQ0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPECC1LQ69YQ0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPECC1LQ69YQ0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPECC1LQ69YQ0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPECC1LQ69YQ0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPECC1LQ69YQ0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPECC1LQ69YQ0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPECC1LQ69YQ0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPECC1LQ69YQ0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPECC1LQ69YQ0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPECC1LQ69YQ0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPECC1LQ69YQ0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPECC1LQ69YQ0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPECC1LQ69YQ0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPECC1LQ69YQ0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPECC1LQ69YQ0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPECC1LQ69YQ0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPECC1LQ69YQ0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPECC1LQ69YQ0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPECC1LQ69YQ0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPECC1LQ69YQ0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPECC1LQ69YQ0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPECC1LQ69YQ0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPECC1LQ69YQ0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SPECC1LQ69YQ0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPECC1LQ69YQ0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPECC1LQ69YQ0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPECC1LQ69YQ0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPECC1LQ69YQ0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPECC1LQ69YQ0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPECC1LQ69YQ0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPECC1LQ69YQ0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPECC1LQ69YQ0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPECC1LQ69YQ0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPECC1LQ69YQ0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPECC1LQ69YQ0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPECC1LQ69YQ0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPECC1LQ69YQ0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPECC1LQ69YQ0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
SPECC1LQ69YQ0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SPECC1LQ69YQ0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SPECC1LQ69YQ0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SPECC1LQ69YQ0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPECC1LQ69YQ0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPECC1LQ69YQ0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPECC1LQ69YQ0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPECC1LQ69YQ0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPECC1LQ69YQ0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPECC1LQ69YQ0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPECC1LQ69YQ0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SPECC1LQ69YQ0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPECC1LQ69YQ0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPECC1LQ69YQ0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPECC1LQ69YQ0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPECC1LQ69YQ0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPECC1LQ69YQ0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPECC1LQ69YQ0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPECC1LQ69YQ0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPECC1LQ69YQ0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPECC1LQ69YQ0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPECC1LQ69YQ0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms