Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHEQ5VZ18 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHEQ5VZ18 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHEQ5VZ18 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHEQ5VZ18 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHEQ5VZ18 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHEQ5VZ18 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHEQ5VZ18 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SHEQ5VZ18 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHEQ5VZ18 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHEQ5VZ18 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHEQ5VZ18 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHEQ5VZ18 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHEQ5VZ18 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SHEQ5VZ18 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHEQ5VZ18 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHEQ5VZ18 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHEQ5VZ18 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHEQ5VZ18 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHEQ5VZ18 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHEQ5VZ18 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHEQ5VZ18 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHEQ5VZ18 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHEQ5VZ18 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHEQ5VZ18 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHEQ5VZ18 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHEQ5VZ18 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHEQ5VZ18 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHEQ5VZ18 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHEQ5VZ18 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHEQ5VZ18 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHEQ5VZ18 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHEQ5VZ18 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHEQ5VZ18 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SHEQ5VZ18 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHEQ5VZ18 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHEQ5VZ18 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHEQ5VZ18 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHEQ5VZ18 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHEQ5VZ18 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SHEQ5VZ18 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHEQ5VZ18 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHEQ5VZ18 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms