Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXT5

SYPL2, Synaptophysin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL2Q5VXT5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYPL2Q5VXT5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYPL2Q5VXT5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYPL2Q5VXT5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYPL2Q5VXT5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYPL2Q5VXT5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYPL2Q5VXT5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYPL2Q5VXT5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYPL2Q5VXT5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYPL2Q5VXT5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYPL2Q5VXT5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYPL2Q5VXT5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYPL2Q5VXT5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYPL2Q5VXT5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYPL2Q5VXT5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYPL2Q5VXT5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYPL2Q5VXT5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYPL2Q5VXT5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYPL2Q5VXT5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SYPL2Q5VXT5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYPL2Q5VXT5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYPL2Q5VXT5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYPL2Q5VXT5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYPL2Q5VXT5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYPL2Q5VXT5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYPL2Q5VXT5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYPL2Q5VXT5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYPL2Q5VXT5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYPL2Q5VXT5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYPL2Q5VXT5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYPL2Q5VXT5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYPL2Q5VXT5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYPL2Q5VXT5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYPL2Q5VXT5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYPL2Q5VXT5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SYPL2Q5VXT5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYPL2Q5VXT5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYPL2Q5VXT5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYPL2Q5VXT5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYPL2Q5VXT5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYPL2Q5VXT5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYPL2Q5VXT5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYPL2Q5VXT5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYPL2Q5VXT5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYPL2Q5VXT5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SYPL2Q5VXT5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYPL2Q5VXT5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYPL2Q5VXT5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYPL2Q5VXT5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYPL2Q5VXT5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYPL2Q5VXT5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYPL2Q5VXT5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYPL2Q5VXT5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYPL2Q5VXT5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYPL2Q5VXT5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYPL2Q5VXT5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYPL2Q5VXT5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYPL2Q5VXT5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYPL2Q5VXT5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYPL2Q5VXT5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYPL2Q5VXT5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYPL2Q5VXT5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYPL2Q5VXT5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYPL2Q5VXT5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYPL2Q5VXT5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYPL2Q5VXT5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYPL2Q5VXT5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYPL2Q5VXT5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYPL2Q5VXT5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYPL2Q5VXT5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SYPL2Q5VXT5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYPL2Q5VXT5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYPL2Q5VXT5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYPL2Q5VXT5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYPL2Q5VXT5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYPL2Q5VXT5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYPL2Q5VXT5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYPL2Q5VXT5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYPL2Q5VXT5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYPL2Q5VXT5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SYPL2Q5VXT5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYPL2Q5VXT5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYPL2Q5VXT5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYPL2Q5VXT5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYPL2Q5VXT5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SYPL2Q5VXT5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SYPL2Q5VXT5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYPL2Q5VXT5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYPL2Q5VXT5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYPL2Q5VXT5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYPL2Q5VXT5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYPL2Q5VXT5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SYPL2Q5VXT5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYPL2Q5VXT5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYPL2Q5VXT5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SYPL2Q5VXT5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYPL2Q5VXT5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYPL2Q5VXT5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYPL2Q5VXT5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYPL2Q5VXT5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms