Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM3

PRAMEF18, PRAME family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF18Q5VWM3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRAMEF18Q5VWM3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PRAMEF18Q5VWM3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRAMEF18Q5VWM3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRAMEF18Q5VWM3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRAMEF18Q5VWM3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRAMEF18Q5VWM3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRAMEF18Q5VWM3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRAMEF18Q5VWM3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRAMEF18Q5VWM3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRAMEF18Q5VWM3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PRAMEF18Q5VWM3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRAMEF18Q5VWM3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRAMEF18Q5VWM3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRAMEF18Q5VWM3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRAMEF18Q5VWM3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRAMEF18Q5VWM3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRAMEF18Q5VWM3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRAMEF18Q5VWM3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PRAMEF18Q5VWM3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRAMEF18Q5VWM3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRAMEF18Q5VWM3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRAMEF18Q5VWM3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PRAMEF18Q5VWM3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
PRAMEF18Q5VWM3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRAMEF18Q5VWM3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRAMEF18Q5VWM3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRAMEF18Q5VWM3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRAMEF18Q5VWM3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PRAMEF18Q5VWM3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRAMEF18Q5VWM3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRAMEF18Q5VWM3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRAMEF18Q5VWM3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRAMEF18Q5VWM3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRAMEF18Q5VWM3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRAMEF18Q5VWM3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRAMEF18Q5VWM3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRAMEF18Q5VWM3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRAMEF18Q5VWM3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRAMEF18Q5VWM3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRAMEF18Q5VWM3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRAMEF18Q5VWM3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRAMEF18Q5VWM3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRAMEF18Q5VWM3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRAMEF18Q5VWM3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRAMEF18Q5VWM3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PRAMEF18Q5VWM3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRAMEF18Q5VWM3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRAMEF18Q5VWM3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRAMEF18Q5VWM3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRAMEF18Q5VWM3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRAMEF18Q5VWM3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRAMEF18Q5VWM3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRAMEF18Q5VWM3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRAMEF18Q5VWM3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRAMEF18Q5VWM3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRAMEF18Q5VWM3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRAMEF18Q5VWM3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRAMEF18Q5VWM3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRAMEF18Q5VWM3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRAMEF18Q5VWM3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRAMEF18Q5VWM3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PRAMEF18Q5VWM3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRAMEF18Q5VWM3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRAMEF18Q5VWM3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRAMEF18Q5VWM3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRAMEF18Q5VWM3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PRAMEF18Q5VWM3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRAMEF18Q5VWM3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRAMEF18Q5VWM3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRAMEF18Q5VWM3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRAMEF18Q5VWM3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRAMEF18Q5VWM3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRAMEF18Q5VWM3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRAMEF18Q5VWM3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRAMEF18Q5VWM3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRAMEF18Q5VWM3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRAMEF18Q5VWM3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRAMEF18Q5VWM3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRAMEF18Q5VWM3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PRAMEF18Q5VWM3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRAMEF18Q5VWM3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRAMEF18Q5VWM3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRAMEF18Q5VWM3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRAMEF18Q5VWM3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRAMEF18Q5VWM3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRAMEF18Q5VWM3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRAMEF18Q5VWM3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRAMEF18Q5VWM3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRAMEF18Q5VWM3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PRAMEF18Q5VWM3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRAMEF18Q5VWM3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRAMEF18Q5VWM3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRAMEF18Q5VWM3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRAMEF18Q5VWM3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRAMEF18Q5VWM3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRAMEF18Q5VWM3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms