Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVQ6

YOD1, Ubiquitin thioesterase OTU1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YOD1Q5VVQ6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
YOD1Q5VVQ6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
YOD1Q5VVQ6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
YOD1Q5VVQ6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YOD1Q5VVQ6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
YOD1Q5VVQ6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YOD1Q5VVQ6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YOD1Q5VVQ6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YOD1Q5VVQ6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YOD1Q5VVQ6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YOD1Q5VVQ6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
YOD1Q5VVQ6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YOD1Q5VVQ6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YOD1Q5VVQ6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YOD1Q5VVQ6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YOD1Q5VVQ6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YOD1Q5VVQ6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YOD1Q5VVQ6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YOD1Q5VVQ6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YOD1Q5VVQ6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YOD1Q5VVQ6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YOD1Q5VVQ6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YOD1Q5VVQ6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YOD1Q5VVQ6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YOD1Q5VVQ6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YOD1Q5VVQ6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YOD1Q5VVQ6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
YOD1Q5VVQ6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
YOD1Q5VVQ6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YOD1Q5VVQ6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YOD1Q5VVQ6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YOD1Q5VVQ6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YOD1Q5VVQ6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YOD1Q5VVQ6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YOD1Q5VVQ6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YOD1Q5VVQ6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YOD1Q5VVQ6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YOD1Q5VVQ6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YOD1Q5VVQ6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms