Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
WDR78Q5VTH9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
WDR78Q5VTH9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
WDR78Q5VTH9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
WDR78Q5VTH9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
WDR78Q5VTH9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
WDR78Q5VTH9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
WDR78Q5VTH9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
WDR78Q5VTH9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
WDR78Q5VTH9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
WDR78Q5VTH9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
WDR78Q5VTH9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
WDR78Q5VTH9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
WDR78Q5VTH9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
WDR78Q5VTH9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
WDR78Q5VTH9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
WDR78Q5VTH9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
WDR78Q5VTH9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
WDR78Q5VTH9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
WDR78Q5VTH9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
WDR78Q5VTH9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
WDR78Q5VTH9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
WDR78Q5VTH9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
WDR78Q5VTH9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
WDR78Q5VTH9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
WDR78Q5VTH9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
WDR78Q5VTH9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
WDR78Q5VTH9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
WDR78Q5VTH9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
WDR78Q5VTH9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
WDR78Q5VTH9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
WDR78Q5VTH9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
WDR78Q5VTH9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
WDR78Q5VTH9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
WDR78Q5VTH9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
WDR78Q5VTH9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
WDR78Q5VTH9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
WDR78Q5VTH9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
WDR78Q5VTH9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
WDR78Q5VTH9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
WDR78Q5VTH9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
WDR78Q5VTH9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
WDR78Q5VTH9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
WDR78Q5VTH9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
WDR78Q5VTH9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
WDR78Q5VTH9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
WDR78Q5VTH9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
WDR78Q5VTH9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
WDR78Q5VTH9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
WDR78Q5VTH9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
WDR78Q5VTH9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
WDR78Q5VTH9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
WDR78Q5VTH9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
WDR78Q5VTH9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
WDR78Q5VTH9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
WDR78Q5VTH9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
WDR78Q5VTH9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
WDR78Q5VTH9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
WDR78Q5VTH9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
WDR78Q5VTH9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
WDR78Q5VTH9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
WDR78Q5VTH9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
WDR78Q5VTH9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
WDR78Q5VTH9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
WDR78Q5VTH9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
WDR78Q5VTH9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
WDR78Q5VTH9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
WDR78Q5VTH9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
WDR78Q5VTH9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
WDR78Q5VTH9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
WDR78Q5VTH9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
WDR78Q5VTH9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
WDR78Q5VTH9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
WDR78Q5VTH9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
WDR78Q5VTH9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
WDR78Q5VTH9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
WDR78Q5VTH9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
WDR78Q5VTH9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
WDR78Q5VTH9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
WDR78Q5VTH9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
WDR78Q5VTH9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
WDR78Q5VTH9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
WDR78Q5VTH9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
WDR78Q5VTH9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
WDR78Q5VTH9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
WDR78Q5VTH9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
WDR78Q5VTH9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
WDR78Q5VTH9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
WDR78Q5VTH9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
WDR78Q5VTH9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
WDR78Q5VTH9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
WDR78Q5VTH9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
WDR78Q5VTH9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
WDR78Q5VTH9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
WDR78Q5VTH9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
WDR78Q5VTH9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
WDR78Q5VTH9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
WDR78Q5VTH9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
WDR78Q5VTH9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
WDR78Q5VTH9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms