Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTE0

EEF1A1P5, Putative elongation factor 1-alpha-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P5Q5VTE0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
EEF1A1P5Q5VTE0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms