Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM164Q5U3C3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM164Q5U3C3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM164Q5U3C3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM164Q5U3C3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM164Q5U3C3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM164Q5U3C3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM164Q5U3C3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM164Q5U3C3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM164Q5U3C3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM164Q5U3C3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM164Q5U3C3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM164Q5U3C3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM164Q5U3C3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM164Q5U3C3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM164Q5U3C3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM164Q5U3C3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM164Q5U3C3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM164Q5U3C3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM164Q5U3C3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM164Q5U3C3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM164Q5U3C3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM164Q5U3C3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM164Q5U3C3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM164Q5U3C3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM164Q5U3C3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM164Q5U3C3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM164Q5U3C3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM164Q5U3C3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM164Q5U3C3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM164Q5U3C3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM164Q5U3C3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM164Q5U3C3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM164Q5U3C3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM164Q5U3C3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM164Q5U3C3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM164Q5U3C3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM164Q5U3C3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM164Q5U3C3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM164Q5U3C3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM164Q5U3C3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM164Q5U3C3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM164Q5U3C3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM164Q5U3C3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM164Q5U3C3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM164Q5U3C3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM164Q5U3C3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM164Q5U3C3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM164Q5U3C3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM164Q5U3C3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM164Q5U3C3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM164Q5U3C3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM164Q5U3C3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM164Q5U3C3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM164Q5U3C3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM164Q5U3C3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM164Q5U3C3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms