Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGY1

TMCO4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO4Q5TGY1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMCO4Q5TGY1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMCO4Q5TGY1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMCO4Q5TGY1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMCO4Q5TGY1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms