Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
UBAP2Q5T6F2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBAP2Q5T6F2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBAP2Q5T6F2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBAP2Q5T6F2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBAP2Q5T6F2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBAP2Q5T6F2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBAP2Q5T6F2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBAP2Q5T6F2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBAP2Q5T6F2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
UBAP2Q5T6F2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBAP2Q5T6F2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
UBAP2Q5T6F2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBAP2Q5T6F2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBAP2Q5T6F2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBAP2Q5T6F2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBAP2Q5T6F2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBAP2Q5T6F2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBAP2Q5T6F2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBAP2Q5T6F2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBAP2Q5T6F2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBAP2Q5T6F2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms