Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LDLRAP1Q5SW96 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LDLRAP1Q5SW96 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LDLRAP1Q5SW96 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LDLRAP1Q5SW96 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LDLRAP1Q5SW96 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LDLRAP1Q5SW96 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LDLRAP1Q5SW96 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LDLRAP1Q5SW96 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LDLRAP1Q5SW96 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LDLRAP1Q5SW96 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LDLRAP1Q5SW96 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LDLRAP1Q5SW96 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LDLRAP1Q5SW96 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LDLRAP1Q5SW96 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LDLRAP1Q5SW96 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LDLRAP1Q5SW96 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LDLRAP1Q5SW96 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LDLRAP1Q5SW96 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LDLRAP1Q5SW96 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LDLRAP1Q5SW96 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LDLRAP1Q5SW96 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LDLRAP1Q5SW96 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LDLRAP1Q5SW96 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LDLRAP1Q5SW96 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LDLRAP1Q5SW96 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LDLRAP1Q5SW96 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LDLRAP1Q5SW96 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LDLRAP1Q5SW96 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LDLRAP1Q5SW96 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LDLRAP1Q5SW96 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LDLRAP1Q5SW96 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LDLRAP1Q5SW96 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LDLRAP1Q5SW96 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LDLRAP1Q5SW96 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LDLRAP1Q5SW96 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LDLRAP1Q5SW96 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LDLRAP1Q5SW96 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LDLRAP1Q5SW96 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LDLRAP1Q5SW96 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LDLRAP1Q5SW96 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LDLRAP1Q5SW96 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LDLRAP1Q5SW96 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LDLRAP1Q5SW96 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LDLRAP1Q5SW96 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LDLRAP1Q5SW96 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LDLRAP1Q5SW96 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LDLRAP1Q5SW96 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LDLRAP1Q5SW96 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LDLRAP1Q5SW96 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LDLRAP1Q5SW96 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LDLRAP1Q5SW96 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LDLRAP1Q5SW96 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LDLRAP1Q5SW96 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LDLRAP1Q5SW96 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LDLRAP1Q5SW96 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LDLRAP1Q5SW96 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LDLRAP1Q5SW96 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LDLRAP1Q5SW96 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LDLRAP1Q5SW96 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LDLRAP1Q5SW96 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LDLRAP1Q5SW96 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LDLRAP1Q5SW96 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LDLRAP1Q5SW96 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LDLRAP1Q5SW96 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LDLRAP1Q5SW96 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LDLRAP1Q5SW96 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LDLRAP1Q5SW96 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LDLRAP1Q5SW96 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LDLRAP1Q5SW96 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LDLRAP1Q5SW96 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LDLRAP1Q5SW96 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LDLRAP1Q5SW96 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LDLRAP1Q5SW96 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LDLRAP1Q5SW96 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LDLRAP1Q5SW96 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LDLRAP1Q5SW96 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LDLRAP1Q5SW96 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LDLRAP1Q5SW96 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LDLRAP1Q5SW96 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LDLRAP1Q5SW96 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LDLRAP1Q5SW96 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LDLRAP1Q5SW96 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LDLRAP1Q5SW96 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LDLRAP1Q5SW96 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LDLRAP1Q5SW96 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LDLRAP1Q5SW96 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LDLRAP1Q5SW96 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LDLRAP1Q5SW96 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LDLRAP1Q5SW96 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LDLRAP1Q5SW96 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LDLRAP1Q5SW96 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LDLRAP1Q5SW96 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LDLRAP1Q5SW96 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LDLRAP1Q5SW96 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LDLRAP1Q5SW96 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LDLRAP1Q5SW96 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LDLRAP1Q5SW96 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LDLRAP1Q5SW96 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LDLRAP1Q5SW96 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms