Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NUP188Q5SRE5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NUP188Q5SRE5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NUP188Q5SRE5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NUP188Q5SRE5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
NUP188Q5SRE5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NUP188Q5SRE5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
NUP188Q5SRE5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
NUP188Q5SRE5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
NUP188Q5SRE5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NUP188Q5SRE5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NUP188Q5SRE5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NUP188Q5SRE5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NUP188Q5SRE5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NUP188Q5SRE5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NUP188Q5SRE5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NUP188Q5SRE5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NUP188Q5SRE5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NUP188Q5SRE5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NUP188Q5SRE5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NUP188Q5SRE5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NUP188Q5SRE5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
NUP188Q5SRE5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NUP188Q5SRE5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NUP188Q5SRE5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NUP188Q5SRE5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NUP188Q5SRE5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NUP188Q5SRE5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NUP188Q5SRE5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NUP188Q5SRE5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
NUP188Q5SRE5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NUP188Q5SRE5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NUP188Q5SRE5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NUP188Q5SRE5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NUP188Q5SRE5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NUP188Q5SRE5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
NUP188Q5SRE5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NUP188Q5SRE5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NUP188Q5SRE5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NUP188Q5SRE5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NUP188Q5SRE5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NUP188Q5SRE5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NUP188Q5SRE5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NUP188Q5SRE5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NUP188Q5SRE5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
NUP188Q5SRE5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NUP188Q5SRE5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NUP188Q5SRE5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NUP188Q5SRE5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NUP188Q5SRE5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NUP188Q5SRE5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NUP188Q5SRE5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NUP188Q5SRE5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NUP188Q5SRE5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NUP188Q5SRE5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NUP188Q5SRE5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NUP188Q5SRE5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NUP188Q5SRE5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NUP188Q5SRE5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NUP188Q5SRE5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NUP188Q5SRE5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NUP188Q5SRE5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NUP188Q5SRE5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NUP188Q5SRE5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NUP188Q5SRE5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
NUP188Q5SRE5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NUP188Q5SRE5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NUP188Q5SRE5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NUP188Q5SRE5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NUP188Q5SRE5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NUP188Q5SRE5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NUP188Q5SRE5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
NUP188Q5SRE5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
NUP188Q5SRE5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NUP188Q5SRE5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
NUP188Q5SRE5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NUP188Q5SRE5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NUP188Q5SRE5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NUP188Q5SRE5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NUP188Q5SRE5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NUP188Q5SRE5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NUP188Q5SRE5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NUP188Q5SRE5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
NUP188Q5SRE5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NUP188Q5SRE5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NUP188Q5SRE5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NUP188Q5SRE5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NUP188Q5SRE5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
NUP188Q5SRE5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NUP188Q5SRE5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NUP188Q5SRE5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NUP188Q5SRE5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NUP188Q5SRE5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NUP188Q5SRE5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NUP188Q5SRE5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NUP188Q5SRE5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NUP188Q5SRE5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NUP188Q5SRE5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NUP188Q5SRE5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NUP188Q5SRE5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms