Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CEP78Q5JTW2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CEP78Q5JTW2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CEP78Q5JTW2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CEP78Q5JTW2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CEP78Q5JTW2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CEP78Q5JTW2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CEP78Q5JTW2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CEP78Q5JTW2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CEP78Q5JTW2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CEP78Q5JTW2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CEP78Q5JTW2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CEP78Q5JTW2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CEP78Q5JTW2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CEP78Q5JTW2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CEP78Q5JTW2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CEP78Q5JTW2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CEP78Q5JTW2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CEP78Q5JTW2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CEP78Q5JTW2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CEP78Q5JTW2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CEP78Q5JTW2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CEP78Q5JTW2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CEP78Q5JTW2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CEP78Q5JTW2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CEP78Q5JTW2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CEP78Q5JTW2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CEP78Q5JTW2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CEP78Q5JTW2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CEP78Q5JTW2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CEP78Q5JTW2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CEP78Q5JTW2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CEP78Q5JTW2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CEP78Q5JTW2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CEP78Q5JTW2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CEP78Q5JTW2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CEP78Q5JTW2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CEP78Q5JTW2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CEP78Q5JTW2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CEP78Q5JTW2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms