Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC9

EIPR1, EARP-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIPR1Q53HC9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIPR1Q53HC9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIPR1Q53HC9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIPR1Q53HC9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIPR1Q53HC9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIPR1Q53HC9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIPR1Q53HC9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIPR1Q53HC9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIPR1Q53HC9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIPR1Q53HC9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIPR1Q53HC9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIPR1Q53HC9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
EIPR1Q53HC9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIPR1Q53HC9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIPR1Q53HC9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIPR1Q53HC9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIPR1Q53HC9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIPR1Q53HC9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIPR1Q53HC9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIPR1Q53HC9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIPR1Q53HC9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIPR1Q53HC9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIPR1Q53HC9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIPR1Q53HC9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIPR1Q53HC9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIPR1Q53HC9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIPR1Q53HC9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIPR1Q53HC9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIPR1Q53HC9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIPR1Q53HC9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIPR1Q53HC9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EIPR1Q53HC9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIPR1Q53HC9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIPR1Q53HC9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIPR1Q53HC9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIPR1Q53HC9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EIPR1Q53HC9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EIPR1Q53HC9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIPR1Q53HC9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIPR1Q53HC9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIPR1Q53HC9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIPR1Q53HC9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIPR1Q53HC9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIPR1Q53HC9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIPR1Q53HC9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIPR1Q53HC9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIPR1Q53HC9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIPR1Q53HC9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIPR1Q53HC9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIPR1Q53HC9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIPR1Q53HC9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EIPR1Q53HC9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIPR1Q53HC9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIPR1Q53HC9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIPR1Q53HC9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIPR1Q53HC9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIPR1Q53HC9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EIPR1Q53HC9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EIPR1Q53HC9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
EIPR1Q53HC9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EIPR1Q53HC9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EIPR1Q53HC9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EIPR1Q53HC9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EIPR1Q53HC9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EIPR1Q53HC9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EIPR1Q53HC9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EIPR1Q53HC9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EIPR1Q53HC9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIPR1Q53HC9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIPR1Q53HC9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIPR1Q53HC9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIPR1Q53HC9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIPR1Q53HC9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIPR1Q53HC9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIPR1Q53HC9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIPR1Q53HC9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIPR1Q53HC9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EIPR1Q53HC9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIPR1Q53HC9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIPR1Q53HC9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIPR1Q53HC9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIPR1Q53HC9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EIPR1Q53HC9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIPR1Q53HC9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIPR1Q53HC9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIPR1Q53HC9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIPR1Q53HC9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIPR1Q53HC9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIPR1Q53HC9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIPR1Q53HC9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIPR1Q53HC9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIPR1Q53HC9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIPR1Q53HC9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIPR1Q53HC9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIPR1Q53HC9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIPR1Q53HC9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIPR1Q53HC9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIPR1Q53HC9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIPR1Q53HC9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIPR1Q53HC9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms