Protein–RNA interactions for Protein: Q52LA3

LIN52, Protein lin-52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN52Q52LA3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LIN52Q52LA3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LIN52Q52LA3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIN52Q52LA3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIN52Q52LA3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIN52Q52LA3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIN52Q52LA3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIN52Q52LA3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIN52Q52LA3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIN52Q52LA3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIN52Q52LA3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms