Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKDCCQ504Y2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKDCCQ504Y2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKDCCQ504Y2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKDCCQ504Y2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKDCCQ504Y2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PKDCCQ504Y2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKDCCQ504Y2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKDCCQ504Y2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKDCCQ504Y2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKDCCQ504Y2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKDCCQ504Y2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKDCCQ504Y2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKDCCQ504Y2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKDCCQ504Y2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKDCCQ504Y2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKDCCQ504Y2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKDCCQ504Y2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKDCCQ504Y2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKDCCQ504Y2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKDCCQ504Y2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKDCCQ504Y2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKDCCQ504Y2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKDCCQ504Y2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKDCCQ504Y2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKDCCQ504Y2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKDCCQ504Y2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PKDCCQ504Y2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PKDCCQ504Y2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PKDCCQ504Y2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PKDCCQ504Y2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PKDCCQ504Y2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PKDCCQ504Y2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKDCCQ504Y2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKDCCQ504Y2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKDCCQ504Y2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKDCCQ504Y2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKDCCQ504Y2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PKDCCQ504Y2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKDCCQ504Y2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKDCCQ504Y2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKDCCQ504Y2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKDCCQ504Y2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKDCCQ504Y2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PKDCCQ504Y2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PKDCCQ504Y2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKDCCQ504Y2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKDCCQ504Y2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKDCCQ504Y2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKDCCQ504Y2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKDCCQ504Y2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKDCCQ504Y2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKDCCQ504Y2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKDCCQ504Y2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKDCCQ504Y2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKDCCQ504Y2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKDCCQ504Y2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKDCCQ504Y2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKDCCQ504Y2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKDCCQ504Y2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKDCCQ504Y2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKDCCQ504Y2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PKDCCQ504Y2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKDCCQ504Y2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKDCCQ504Y2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PKDCCQ504Y2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKDCCQ504Y2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKDCCQ504Y2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PKDCCQ504Y2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PKDCCQ504Y2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKDCCQ504Y2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKDCCQ504Y2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKDCCQ504Y2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKDCCQ504Y2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKDCCQ504Y2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKDCCQ504Y2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKDCCQ504Y2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKDCCQ504Y2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKDCCQ504Y2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKDCCQ504Y2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKDCCQ504Y2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKDCCQ504Y2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKDCCQ504Y2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKDCCQ504Y2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PKDCCQ504Y2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKDCCQ504Y2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKDCCQ504Y2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKDCCQ504Y2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKDCCQ504Y2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKDCCQ504Y2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKDCCQ504Y2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKDCCQ504Y2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKDCCQ504Y2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKDCCQ504Y2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKDCCQ504Y2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKDCCQ504Y2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKDCCQ504Y2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKDCCQ504Y2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKDCCQ504Y2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKDCCQ504Y2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms