Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTXN3Q4LDR2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTXN3Q4LDR2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTXN3Q4LDR2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTXN3Q4LDR2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTXN3Q4LDR2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTXN3Q4LDR2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CTXN3Q4LDR2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTXN3Q4LDR2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTXN3Q4LDR2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTXN3Q4LDR2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTXN3Q4LDR2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTXN3Q4LDR2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTXN3Q4LDR2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTXN3Q4LDR2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTXN3Q4LDR2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTXN3Q4LDR2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTXN3Q4LDR2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTXN3Q4LDR2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTXN3Q4LDR2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTXN3Q4LDR2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTXN3Q4LDR2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTXN3Q4LDR2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CTXN3Q4LDR2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTXN3Q4LDR2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTXN3Q4LDR2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTXN3Q4LDR2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTXN3Q4LDR2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTXN3Q4LDR2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CTXN3Q4LDR2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTXN3Q4LDR2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CTXN3Q4LDR2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTXN3Q4LDR2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTXN3Q4LDR2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTXN3Q4LDR2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTXN3Q4LDR2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTXN3Q4LDR2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTXN3Q4LDR2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTXN3Q4LDR2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTXN3Q4LDR2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTXN3Q4LDR2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTXN3Q4LDR2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTXN3Q4LDR2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTXN3Q4LDR2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTXN3Q4LDR2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTXN3Q4LDR2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTXN3Q4LDR2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTXN3Q4LDR2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTXN3Q4LDR2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTXN3Q4LDR2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTXN3Q4LDR2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTXN3Q4LDR2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTXN3Q4LDR2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTXN3Q4LDR2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CTXN3Q4LDR2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CTXN3Q4LDR2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CTXN3Q4LDR2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTXN3Q4LDR2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CTXN3Q4LDR2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTXN3Q4LDR2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CTXN3Q4LDR2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTXN3Q4LDR2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTXN3Q4LDR2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTXN3Q4LDR2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTXN3Q4LDR2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTXN3Q4LDR2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTXN3Q4LDR2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTXN3Q4LDR2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CTXN3Q4LDR2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTXN3Q4LDR2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTXN3Q4LDR2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTXN3Q4LDR2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTXN3Q4LDR2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTXN3Q4LDR2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTXN3Q4LDR2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTXN3Q4LDR2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTXN3Q4LDR2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTXN3Q4LDR2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTXN3Q4LDR2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTXN3Q4LDR2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTXN3Q4LDR2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTXN3Q4LDR2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTXN3Q4LDR2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTXN3Q4LDR2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTXN3Q4LDR2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTXN3Q4LDR2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTXN3Q4LDR2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTXN3Q4LDR2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTXN3Q4LDR2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTXN3Q4LDR2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CTXN3Q4LDR2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTXN3Q4LDR2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTXN3Q4LDR2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTXN3Q4LDR2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTXN3Q4LDR2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTXN3Q4LDR2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTXN3Q4LDR2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTXN3Q4LDR2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTXN3Q4LDR2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTXN3Q4LDR2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
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