Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFAP100Q494V2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFAP100Q494V2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFAP100Q494V2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFAP100Q494V2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFAP100Q494V2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFAP100Q494V2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFAP100Q494V2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFAP100Q494V2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFAP100Q494V2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFAP100Q494V2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFAP100Q494V2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFAP100Q494V2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CFAP100Q494V2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFAP100Q494V2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFAP100Q494V2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFAP100Q494V2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CFAP100Q494V2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFAP100Q494V2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFAP100Q494V2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFAP100Q494V2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFAP100Q494V2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFAP100Q494V2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFAP100Q494V2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFAP100Q494V2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFAP100Q494V2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFAP100Q494V2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFAP100Q494V2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFAP100Q494V2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFAP100Q494V2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFAP100Q494V2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFAP100Q494V2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFAP100Q494V2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFAP100Q494V2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFAP100Q494V2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFAP100Q494V2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFAP100Q494V2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFAP100Q494V2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFAP100Q494V2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFAP100Q494V2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFAP100Q494V2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CFAP100Q494V2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFAP100Q494V2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CFAP100Q494V2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFAP100Q494V2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFAP100Q494V2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFAP100Q494V2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFAP100Q494V2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFAP100Q494V2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFAP100Q494V2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFAP100Q494V2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFAP100Q494V2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFAP100Q494V2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFAP100Q494V2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CFAP100Q494V2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CFAP100Q494V2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CFAP100Q494V2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFAP100Q494V2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFAP100Q494V2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CFAP100Q494V2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CFAP100Q494V2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CFAP100Q494V2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CFAP100Q494V2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CFAP100Q494V2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFAP100Q494V2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFAP100Q494V2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CFAP100Q494V2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFAP100Q494V2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CFAP100Q494V2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CFAP100Q494V2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CFAP100Q494V2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CFAP100Q494V2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CFAP100Q494V2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CFAP100Q494V2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CFAP100Q494V2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CFAP100Q494V2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CFAP100Q494V2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CFAP100Q494V2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CFAP100Q494V2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CFAP100Q494V2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CFAP100Q494V2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CFAP100Q494V2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CFAP100Q494V2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CFAP100Q494V2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CFAP100Q494V2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CFAP100Q494V2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CFAP100Q494V2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CFAP100Q494V2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP100Q494V2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP100Q494V2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP100Q494V2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP100Q494V2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP100Q494V2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP100Q494V2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP100Q494V2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP100Q494V2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP100Q494V2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP100Q494V2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP100Q494V2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP100Q494V2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms