Protein–RNA interactions for Protein: Q3T906

GNPTAB, N-acetylglucosamine-1-phosphotransferase subunits alpha/beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTABQ3T906 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
GNPTABQ3T906 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GNPTABQ3T906 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GNPTABQ3T906 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GNPTABQ3T906 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GNPTABQ3T906 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GNPTABQ3T906 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GNPTABQ3T906 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GNPTABQ3T906 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GNPTABQ3T906 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GNPTABQ3T906 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GNPTABQ3T906 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GNPTABQ3T906 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GNPTABQ3T906 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GNPTABQ3T906 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GNPTABQ3T906 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GNPTABQ3T906 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GNPTABQ3T906 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GNPTABQ3T906 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GNPTABQ3T906 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GNPTABQ3T906 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GNPTABQ3T906 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GNPTABQ3T906 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GNPTABQ3T906 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GNPTABQ3T906 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GNPTABQ3T906 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GNPTABQ3T906 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GNPTABQ3T906 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GNPTABQ3T906 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GNPTABQ3T906 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GNPTABQ3T906 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GNPTABQ3T906 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GNPTABQ3T906 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GNPTABQ3T906 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GNPTABQ3T906 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GNPTABQ3T906 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GNPTABQ3T906 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GNPTABQ3T906 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GNPTABQ3T906 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GNPTABQ3T906 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GNPTABQ3T906 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GNPTABQ3T906 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GNPTABQ3T906 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GNPTABQ3T906 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GNPTABQ3T906 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GNPTABQ3T906 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GNPTABQ3T906 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GNPTABQ3T906 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GNPTABQ3T906 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GNPTABQ3T906 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GNPTABQ3T906 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GNPTABQ3T906 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GNPTABQ3T906 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GNPTABQ3T906 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GNPTABQ3T906 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GNPTABQ3T906 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GNPTABQ3T906 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GNPTABQ3T906 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GNPTABQ3T906 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GNPTABQ3T906 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GNPTABQ3T906 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GNPTABQ3T906 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GNPTABQ3T906 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
GNPTABQ3T906 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GNPTABQ3T906 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GNPTABQ3T906 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GNPTABQ3T906 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GNPTABQ3T906 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GNPTABQ3T906 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GNPTABQ3T906 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GNPTABQ3T906 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GNPTABQ3T906 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GNPTABQ3T906 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GNPTABQ3T906 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GNPTABQ3T906 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GNPTABQ3T906 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GNPTABQ3T906 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GNPTABQ3T906 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GNPTABQ3T906 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GNPTABQ3T906 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GNPTABQ3T906 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GNPTABQ3T906 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GNPTABQ3T906 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GNPTABQ3T906 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GNPTABQ3T906 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GNPTABQ3T906 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GNPTABQ3T906 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GNPTABQ3T906 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GNPTABQ3T906 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GNPTABQ3T906 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GNPTABQ3T906 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GNPTABQ3T906 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GNPTABQ3T906 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GNPTABQ3T906 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
GNPTABQ3T906 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
GNPTABQ3T906 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GNPTABQ3T906 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GNPTABQ3T906 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GNPTABQ3T906 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GNPTABQ3T906 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms