Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP41Q3LFD5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP41Q3LFD5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP41Q3LFD5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP41Q3LFD5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP41Q3LFD5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP41Q3LFD5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP41Q3LFD5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP41Q3LFD5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP41Q3LFD5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP41Q3LFD5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP41Q3LFD5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP41Q3LFD5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP41Q3LFD5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP41Q3LFD5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP41Q3LFD5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP41Q3LFD5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP41Q3LFD5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP41Q3LFD5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP41Q3LFD5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
USP41Q3LFD5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP41Q3LFD5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP41Q3LFD5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
USP41Q3LFD5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP41Q3LFD5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
USP41Q3LFD5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP41Q3LFD5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP41Q3LFD5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP41Q3LFD5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP41Q3LFD5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP41Q3LFD5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP41Q3LFD5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP41Q3LFD5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP41Q3LFD5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP41Q3LFD5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP41Q3LFD5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP41Q3LFD5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP41Q3LFD5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP41Q3LFD5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP41Q3LFD5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP41Q3LFD5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP41Q3LFD5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP41Q3LFD5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms