Protein–RNA interactions for Protein: Q2I0M5

RSPO4, R-spondin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO4Q2I0M5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RSPO4Q2I0M5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RSPO4Q2I0M5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RSPO4Q2I0M5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RSPO4Q2I0M5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RSPO4Q2I0M5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RSPO4Q2I0M5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RSPO4Q2I0M5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RSPO4Q2I0M5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RSPO4Q2I0M5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RSPO4Q2I0M5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RSPO4Q2I0M5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RSPO4Q2I0M5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RSPO4Q2I0M5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RSPO4Q2I0M5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RSPO4Q2I0M5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RSPO4Q2I0M5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RSPO4Q2I0M5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RSPO4Q2I0M5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RSPO4Q2I0M5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RSPO4Q2I0M5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RSPO4Q2I0M5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RSPO4Q2I0M5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RSPO4Q2I0M5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RSPO4Q2I0M5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RSPO4Q2I0M5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RSPO4Q2I0M5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RSPO4Q2I0M5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RSPO4Q2I0M5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RSPO4Q2I0M5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RSPO4Q2I0M5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RSPO4Q2I0M5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RSPO4Q2I0M5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RSPO4Q2I0M5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RSPO4Q2I0M5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RSPO4Q2I0M5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RSPO4Q2I0M5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RSPO4Q2I0M5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RSPO4Q2I0M5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RSPO4Q2I0M5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RSPO4Q2I0M5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RSPO4Q2I0M5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RSPO4Q2I0M5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RSPO4Q2I0M5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RSPO4Q2I0M5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RSPO4Q2I0M5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RSPO4Q2I0M5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RSPO4Q2I0M5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RSPO4Q2I0M5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RSPO4Q2I0M5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RSPO4Q2I0M5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RSPO4Q2I0M5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RSPO4Q2I0M5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RSPO4Q2I0M5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RSPO4Q2I0M5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RSPO4Q2I0M5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RSPO4Q2I0M5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RSPO4Q2I0M5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RSPO4Q2I0M5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RSPO4Q2I0M5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RSPO4Q2I0M5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RSPO4Q2I0M5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RSPO4Q2I0M5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RSPO4Q2I0M5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RSPO4Q2I0M5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RSPO4Q2I0M5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RSPO4Q2I0M5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RSPO4Q2I0M5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RSPO4Q2I0M5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RSPO4Q2I0M5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RSPO4Q2I0M5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RSPO4Q2I0M5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RSPO4Q2I0M5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RSPO4Q2I0M5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RSPO4Q2I0M5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RSPO4Q2I0M5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RSPO4Q2I0M5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RSPO4Q2I0M5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RSPO4Q2I0M5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RSPO4Q2I0M5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RSPO4Q2I0M5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RSPO4Q2I0M5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RSPO4Q2I0M5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RSPO4Q2I0M5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RSPO4Q2I0M5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RSPO4Q2I0M5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RSPO4Q2I0M5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPO4Q2I0M5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms