Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SWI5Q1ZZU3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SWI5Q1ZZU3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SWI5Q1ZZU3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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