Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKIDA1Q1XH10 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SKIDA1Q1XH10 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKIDA1Q1XH10 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKIDA1Q1XH10 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKIDA1Q1XH10 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKIDA1Q1XH10 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKIDA1Q1XH10 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SKIDA1Q1XH10 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKIDA1Q1XH10 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKIDA1Q1XH10 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKIDA1Q1XH10 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKIDA1Q1XH10 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKIDA1Q1XH10 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKIDA1Q1XH10 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKIDA1Q1XH10 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKIDA1Q1XH10 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKIDA1Q1XH10 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKIDA1Q1XH10 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKIDA1Q1XH10 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SKIDA1Q1XH10 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SKIDA1Q1XH10 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SKIDA1Q1XH10 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKIDA1Q1XH10 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
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