Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q1T7F1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q1T7F1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q1T7F1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q1T7F1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q1T7F1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q1T7F1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q1T7F1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q1T7F1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q1T7F1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Q1T7F1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q1T7F1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q1T7F1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q1T7F1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q1T7F1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q1T7F1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q1T7F1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q1T7F1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q1T7F1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q1T7F1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q1T7F1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q1T7F1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q1T7F1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q1T7F1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q1T7F1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q1T7F1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q1T7F1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q1T7F1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q1T7F1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q1T7F1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q1T7F1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q1T7F1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q1T7F1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q1T7F1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q1T7F1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q1T7F1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q1T7F1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q1T7F1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q1T7F1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q1T7F1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q1T7F1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q1T7F1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q1T7F1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q1T7F1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q1T7F1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q1T7F1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q1T7F1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q1T7F1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q1T7F1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q1T7F1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q1T7F1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q1T7F1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Q1T7F1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q1T7F1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q1T7F1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q1T7F1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q1T7F1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q1T7F1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q1T7F1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q1T7F1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q1T7F1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q1T7F1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q1T7F1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q1T7F1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q1T7F1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q1T7F1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q1T7F1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q1T7F1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q1T7F1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q1T7F1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q1T7F1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q1T7F1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q1T7F1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q1T7F1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q1T7F1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q1T7F1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q1T7F1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q1T7F1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q1T7F1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q1T7F1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q1T7F1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q1T7F1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q1T7F1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q1T7F1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q1T7F1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q1T7F1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q1T7F1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q1T7F1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q1T7F1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q1T7F1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q1T7F1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q1T7F1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q1T7F1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q1T7F1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q1T7F1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q1T7F1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q1T7F1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q1T7F1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q1T7F1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q1T7F1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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