Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TXNRD1Q16881 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TXNRD1Q16881 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TXNRD1Q16881 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TXNRD1Q16881 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TXNRD1Q16881 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TXNRD1Q16881 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TXNRD1Q16881 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TXNRD1Q16881 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TXNRD1Q16881 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
TXNRD1Q16881 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TXNRD1Q16881 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TXNRD1Q16881 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
TXNRD1Q16881 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
TXNRD1Q16881 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TXNRD1Q16881 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TXNRD1Q16881 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TXNRD1Q16881 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TXNRD1Q16881 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TXNRD1Q16881 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
TXNRD1Q16881 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TXNRD1Q16881 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TXNRD1Q16881 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TXNRD1Q16881 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TXNRD1Q16881 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TXNRD1Q16881 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TXNRD1Q16881 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TXNRD1Q16881 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
TXNRD1Q16881 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TXNRD1Q16881 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TXNRD1Q16881 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
TXNRD1Q16881 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TXNRD1Q16881 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TXNRD1Q16881 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TXNRD1Q16881 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TXNRD1Q16881 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TXNRD1Q16881 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TXNRD1Q16881 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TXNRD1Q16881 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TXNRD1Q16881 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TXNRD1Q16881 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TXNRD1Q16881 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TXNRD1Q16881 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TXNRD1Q16881 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TXNRD1Q16881 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
TXNRD1Q16881 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TXNRD1Q16881 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TXNRD1Q16881 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TXNRD1Q16881 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TXNRD1Q16881 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TXNRD1Q16881 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TXNRD1Q16881 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TXNRD1Q16881 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TXNRD1Q16881 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
TXNRD1Q16881 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TXNRD1Q16881 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TXNRD1Q16881 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TXNRD1Q16881 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TXNRD1Q16881 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TXNRD1Q16881 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TXNRD1Q16881 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
TXNRD1Q16881 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
TXNRD1Q16881 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TXNRD1Q16881 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
TXNRD1Q16881 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TXNRD1Q16881 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TXNRD1Q16881 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TXNRD1Q16881 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TXNRD1Q16881 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TXNRD1Q16881 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
TXNRD1Q16881 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TXNRD1Q16881 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TXNRD1Q16881 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TXNRD1Q16881 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TXNRD1Q16881 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TXNRD1Q16881 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TXNRD1Q16881 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TXNRD1Q16881 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TXNRD1Q16881 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TXNRD1Q16881 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TXNRD1Q16881 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TXNRD1Q16881 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TXNRD1Q16881 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TXNRD1Q16881 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TXNRD1Q16881 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TXNRD1Q16881 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
TXNRD1Q16881 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TXNRD1Q16881 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TXNRD1Q16881 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TXNRD1Q16881 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
TXNRD1Q16881 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TXNRD1Q16881 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TXNRD1Q16881 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TXNRD1Q16881 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TXNRD1Q16881 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TXNRD1Q16881 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TXNRD1Q16881 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
TXNRD1Q16881 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
TXNRD1Q16881 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TXNRD1Q16881 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.42
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