Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPROQ16827 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPROQ16827 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPROQ16827 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPROQ16827 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPROQ16827 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPROQ16827 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPROQ16827 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPROQ16827 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPROQ16827 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPROQ16827 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPROQ16827 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPROQ16827 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPROQ16827 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPROQ16827 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPROQ16827 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPROQ16827 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPROQ16827 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPROQ16827 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPROQ16827 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPROQ16827 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPROQ16827 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPROQ16827 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPROQ16827 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPROQ16827 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPROQ16827 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPROQ16827 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPROQ16827 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPROQ16827 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPROQ16827 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPROQ16827 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPROQ16827 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPROQ16827 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPROQ16827 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPROQ16827 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPROQ16827 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPROQ16827 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPROQ16827 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPROQ16827 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPROQ16827 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPROQ16827 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPROQ16827 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPROQ16827 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPROQ16827 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPROQ16827 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPROQ16827 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPROQ16827 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPROQ16827 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPROQ16827 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPROQ16827 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPROQ16827 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPROQ16827 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPROQ16827 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPROQ16827 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPROQ16827 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPROQ16827 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPROQ16827 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPROQ16827 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPROQ16827 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPROQ16827 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPROQ16827 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPROQ16827 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPROQ16827 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPROQ16827 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPROQ16827 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPROQ16827 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPROQ16827 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPROQ16827 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPROQ16827 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPROQ16827 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPROQ16827 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPROQ16827 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPROQ16827 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPROQ16827 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPROQ16827 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPROQ16827 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPROQ16827 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPROQ16827 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPROQ16827 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPROQ16827 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPROQ16827 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPROQ16827 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPROQ16827 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPROQ16827 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPROQ16827 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPROQ16827 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPROQ16827 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPROQ16827 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPROQ16827 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPROQ16827 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPROQ16827 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPROQ16827 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPROQ16827 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPROQ16827 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPROQ16827 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPROQ16827 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPROQ16827 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPROQ16827 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPROQ16827 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPROQ16827 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
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