Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ECM1Q16610 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ECM1Q16610 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ECM1Q16610 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ECM1Q16610 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ECM1Q16610 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ECM1Q16610 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ECM1Q16610 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ECM1Q16610 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ECM1Q16610 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ECM1Q16610 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ECM1Q16610 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ECM1Q16610 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ECM1Q16610 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ECM1Q16610 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ECM1Q16610 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ECM1Q16610 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ECM1Q16610 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ECM1Q16610 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ECM1Q16610 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ECM1Q16610 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ECM1Q16610 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ECM1Q16610 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ECM1Q16610 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ECM1Q16610 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ECM1Q16610 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ECM1Q16610 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ECM1Q16610 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ECM1Q16610 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ECM1Q16610 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ECM1Q16610 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ECM1Q16610 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ECM1Q16610 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ECM1Q16610 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ECM1Q16610 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ECM1Q16610 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ECM1Q16610 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ECM1Q16610 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ECM1Q16610 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ECM1Q16610 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ECM1Q16610 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ECM1Q16610 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ECM1Q16610 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ECM1Q16610 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ECM1Q16610 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ECM1Q16610 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ECM1Q16610 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ECM1Q16610 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ECM1Q16610 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ECM1Q16610 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ECM1Q16610 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ECM1Q16610 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ECM1Q16610 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ECM1Q16610 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ECM1Q16610 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ECM1Q16610 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ECM1Q16610 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ECM1Q16610 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ECM1Q16610 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ECM1Q16610 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ECM1Q16610 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ECM1Q16610 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ECM1Q16610 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ECM1Q16610 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ECM1Q16610 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ECM1Q16610 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ECM1Q16610 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ECM1Q16610 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ECM1Q16610 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ECM1Q16610 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ECM1Q16610 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ECM1Q16610 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ECM1Q16610 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ECM1Q16610 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ECM1Q16610 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ECM1Q16610 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ECM1Q16610 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ECM1Q16610 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ECM1Q16610 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ECM1Q16610 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ECM1Q16610 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ECM1Q16610 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ECM1Q16610 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ECM1Q16610 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ECM1Q16610 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ECM1Q16610 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ECM1Q16610 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ECM1Q16610 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ECM1Q16610 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ECM1Q16610 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ECM1Q16610 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ECM1Q16610 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ECM1Q16610 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ECM1Q16610 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ECM1Q16610 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ECM1Q16610 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ECM1Q16610 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ECM1Q16610 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ECM1Q16610 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ECM1Q16610 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
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