Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA1EQ15878 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA1EQ15878 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA1EQ15878 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA1EQ15878 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA1EQ15878 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA1EQ15878 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA1EQ15878 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA1EQ15878 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA1EQ15878 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA1EQ15878 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA1EQ15878 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA1EQ15878 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA1EQ15878 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA1EQ15878 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CACNA1EQ15878 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA1EQ15878 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA1EQ15878 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA1EQ15878 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA1EQ15878 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA1EQ15878 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA1EQ15878 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA1EQ15878 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA1EQ15878 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA1EQ15878 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1EQ15878 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1EQ15878 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1EQ15878 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1EQ15878 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1EQ15878 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1EQ15878 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA1EQ15878 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA1EQ15878 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA1EQ15878 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA1EQ15878 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA1EQ15878 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA1EQ15878 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA1EQ15878 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA1EQ15878 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA1EQ15878 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA1EQ15878 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA1EQ15878 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA1EQ15878 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA1EQ15878 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA1EQ15878 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA1EQ15878 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1EQ15878 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1EQ15878 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1EQ15878 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1EQ15878 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1EQ15878 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1EQ15878 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1EQ15878 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1EQ15878 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1EQ15878 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1EQ15878 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1EQ15878 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1EQ15878 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1EQ15878 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1EQ15878 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1EQ15878 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms