Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYCP1Q15431 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYCP1Q15431 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYCP1Q15431 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYCP1Q15431 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SYCP1Q15431 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYCP1Q15431 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYCP1Q15431 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCP1Q15431 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCP1Q15431 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCP1Q15431 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCP1Q15431 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCP1Q15431 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCP1Q15431 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCP1Q15431 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCP1Q15431 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCP1Q15431 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCP1Q15431 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCP1Q15431 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCP1Q15431 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCP1Q15431 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCP1Q15431 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SYCP1Q15431 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYCP1Q15431 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYCP1Q15431 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYCP1Q15431 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYCP1Q15431 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYCP1Q15431 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYCP1Q15431 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SYCP1Q15431 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYCP1Q15431 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYCP1Q15431 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYCP1Q15431 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCP1Q15431 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCP1Q15431 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCP1Q15431 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCP1Q15431 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCP1Q15431 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCP1Q15431 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCP1Q15431 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCP1Q15431 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCP1Q15431 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCP1Q15431 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCP1Q15431 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCP1Q15431 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCP1Q15431 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCP1Q15431 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCP1Q15431 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCP1Q15431 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCP1Q15431 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCP1Q15431 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCP1Q15431 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCP1Q15431 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCP1Q15431 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCP1Q15431 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCP1Q15431 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCP1Q15431 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCP1Q15431 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCP1Q15431 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCP1Q15431 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCP1Q15431 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCP1Q15431 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCP1Q15431 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCP1Q15431 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCP1Q15431 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCP1Q15431 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCP1Q15431 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCP1Q15431 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCP1Q15431 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCP1Q15431 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCP1Q15431 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCP1Q15431 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCP1Q15431 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCP1Q15431 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCP1Q15431 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCP1Q15431 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCP1Q15431 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCP1Q15431 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCP1Q15431 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCP1Q15431 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SYCP1Q15431 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYCP1Q15431 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYCP1Q15431 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYCP1Q15431 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYCP1Q15431 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYCP1Q15431 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYCP1Q15431 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYCP1Q15431 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYCP1Q15431 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SYCP1Q15431 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCP1Q15431 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCP1Q15431 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCP1Q15431 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCP1Q15431 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCP1Q15431 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCP1Q15431 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYCP1Q15431 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYCP1Q15431 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYCP1Q15431 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYCP1Q15431 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms