Protein–RNA interactions for Protein: Q15061

WDR43, WD repeat-containing protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR43Q15061 UBR4-207ENST00000425413 2954 ntTSL 215.42■□□□□ 0.062e-6■■□□□ 13.8
WDR43Q15061 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.252e-6■■□□□ 13.8
WDR43Q15061 KANK1-210ENST00000619269 5688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.252e-6■■□□□ 13.8
WDR43Q15061 KANK1-206ENST00000382303 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.312e-6■■□□□ 13.8
WDR43Q15061 KANK1-209ENST00000489369 7193 ntTSL 513.02□□□□□ -0.332e-6■■□□□ 13.8
WDR43Q15061 KANK1-205ENST00000382297 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.52e-6■■□□□ 13.8
WDR43Q15061 KANK1-201ENST00000354485 6912 ntTSL 210.92□□□□□ -0.662e-6■■□□□ 13.8
WDR43Q15061 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.711e-14■■□□□ 13.7
WDR43Q15061 GAS5-222ENST00000451607 1007 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 01e-14■■□□□ 13.7
WDR43Q15061 GAS5-224ENST00000454068 688 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.31e-14■■□□□ 13.7
WDR43Q15061 GAS5-214ENST00000436656 822 ntTSL 312.52□□□□□ -0.411e-14■■□□□ 13.7
WDR43Q15061 GAS5-216ENST00000443799 897 ntTSL 512.52□□□□□ -0.411e-14■■□□□ 13.7
WDR43Q15061 GAS5-210ENST00000431268 1698 ntTSL 211.69□□□□□ -0.541e-14■■□□□ 13.7
WDR43Q15061 GAS5-219ENST00000449289 542 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.681e-14■■□□□ 13.7
WDR43Q15061 GAS5-220ENST00000449589 712 ntTSL 310.8□□□□□ -0.681e-14■■□□□ 13.7
WDR43Q15061 GAS5-226ENST00000455838 632 ntTSL 210.8□□□□□ -0.681e-14■■□□□ 13.7
WDR43Q15061 GAS5-203ENST00000416952 799 ntTSL 210.67□□□□□ -0.71e-14■■□□□ 13.7
WDR43Q15061 GAS5-227ENST00000456293 583 ntTSL 39.56□□□□□ -0.881e-14■■□□□ 13.7
WDR43Q15061 GAS5-211ENST00000432536 959 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.921e-14■■□□□ 13.7
WDR43Q15061 GAS5-228ENST00000456812 723 ntTSL 39.14□□□□□ -0.951e-14■■□□□ 13.7
WDR43Q15061 GAS5-206ENST00000422183 745 ntTSL 28.2□□□□□ -1.11e-14■■□□□ 13.7
WDR43Q15061 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.161e-14■■□□□ 13.7
WDR43Q15061 GAS5-201ENST00000412059 979 ntTSL 57.33□□□□□ -1.241e-14■■□□□ 13.7
WDR43Q15061 GAS5-205ENST00000422008 497 ntTSL 36.41□□□□□ -1.381e-14■■□□□ 13.7
WDR43Q15061 GAS5-215ENST00000442067 1114 ntTSL 26.1□□□□□ -1.431e-14■■□□□ 13.7
WDR43Q15061 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.531e-14■■□□□ 13.7
WDR43Q15061 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.551e-14■■□□□ 13.7
WDR43Q15061 GAS5-213ENST00000436285 772 ntTSL 24.77□□□□□ -1.651e-14■■□□□ 13.7
WDR43Q15061 GAS5-204ENST00000421068 1060 ntTSL 24.53□□□□□ -1.681e-14■■□□□ 13.7
WDR43Q15061 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.931e-14■■□□□ 13.7
WDR43Q15061 DSCR4-201ENST00000328264 1098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.084e-6■■□□□ 13.7
WDR43Q15061 DSCR4-202ENST00000398948 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.64e-6■■□□□ 13.7
WDR43Q15061 SPEN-201ENST00000375759 12232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.328e-6■■□□□ 13.7
WDR43Q15061 LDB1-204ENST00000490751 762 ntTSL 241.34■■■■■ 4.218e-9■■□□□ 13.6
WDR43Q15061 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.278e-9■■□□□ 13.6
WDR43Q15061 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.48e-9■■□□□ 13.6
WDR43Q15061 TBRG4-214ENST00000488222 972 ntTSL 322.68■■□□□ 1.228e-9■■□□□ 13.6
WDR43Q15061 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.198e-9■■□□□ 13.6
WDR43Q15061 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.148e-9■■□□□ 13.6
WDR43Q15061 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.958e-9■■□□□ 13.6
WDR43Q15061 TBRG4-204ENST00000461363 856 ntTSL 220.7■□□□□ 0.98e-9■■□□□ 13.6
WDR43Q15061 TBRG4-213ENST00000484326 835 ntTSL 220.7■□□□□ 0.98e-9■■□□□ 13.6
WDR43Q15061 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.798e-9■■□□□ 13.6
WDR43Q15061 TBRG4-209ENST00000478532 945 ntTSL 517.11■□□□□ 0.338e-9■■□□□ 13.6
WDR43Q15061 TBRG4-217ENST00000495973 3409 ntTSL 1 (best)14.9□□□□□ -0.028e-9■■□□□ 13.6
WDR43Q15061 NCAPG2-201ENST00000356309 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.042e-7■■□□□ 13.5
WDR43Q15061 NCAPG2-203ENST00000409423 3957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.412e-7■■□□□ 13.5
WDR43Q15061 NCAPG2-204ENST00000432615 4134 ntTSL 511.07□□□□□ -0.642e-7■■□□□ 13.5
WDR43Q15061 NCAPG2-205ENST00000441982 2926 ntTSL 210.6□□□□□ -0.712e-7■■□□□ 13.5
WDR43Q15061 UBR4-205ENST00000417040 6175 ntTSL 516.07■□□□□ 0.163e-6■■□□□ 13.5
WDR43Q15061 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.942e-8■■□□□ 13.5
WDR43Q15061 CDK12-209ENST00000584632 4165 ntTSL 517.71■□□□□ 0.432e-7■■□□□ 13.5
WDR43Q15061 HNRNPU-212ENST00000638230 1922 ntTSL 515.98■□□□□ 0.152e-6■■□□□ 13.5
WDR43Q15061 HNRNPU-225ENST00000640119 461 ntTSL 515.49■□□□□ 0.072e-6■■□□□ 13.5
WDR43Q15061 HNRNPU-221ENST00000639824 1450 ntTSL 515.04■□□□□ -02e-6■■□□□ 13.5
WDR43Q15061 HNRNPU-216ENST00000638716 2640 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.42e-6■■□□□ 13.5
WDR43Q15061 HNRNPU-218ENST00000639064 2625 ntTSL 512.16□□□□□ -0.462e-6■■□□□ 13.5
WDR43Q15061 HNRNPU-219ENST00000639628 4546 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.572e-6■■□□□ 13.5
WDR43Q15061 HNRNPU-222ENST00000639880 4239 ntTSL 511.23□□□□□ -0.612e-6■■□□□ 13.5
WDR43Q15061 HNRNPU-207ENST00000468690 5273 ntTSL 510.38□□□□□ -0.752e-6■■□□□ 13.5
WDR43Q15061 HNRNPU-223ENST00000640001 4227 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.752e-6■■□□□ 13.5
WDR43Q15061 HNRNPU-213ENST00000638301 3650 ntTSL 58.79□□□□□ -12e-6■■□□□ 13.5
WDR43Q15061 HNRNPU-208ENST00000475997 5290 ntTSL 57.87□□□□□ -1.152e-6■■□□□ 13.5
WDR43Q15061 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.541e-6■■□□□ 13.4
WDR43Q15061 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.712e-6■■□□□ 13.4
WDR43Q15061 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.092e-6■■□□□ 13.4
WDR43Q15061 UBE2I-215ENST00000567074 884 ntTSL 1 (best)24.92■■□□□ 1.582e-6■■□□□ 13.4
WDR43Q15061 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.552e-6■■□□□ 13.4
WDR43Q15061 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.492e-6■■□□□ 13.4
WDR43Q15061 UBE2I-218ENST00000568288 501 ntTSL 523.42■■□□□ 1.342e-6■■□□□ 13.4
WDR43Q15061 UBE2I-217ENST00000568209 266 ntTSL 523.14■■□□□ 1.292e-6■■□□□ 13.4
WDR43Q15061 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.672e-6■■□□□ 13.4
WDR43Q15061 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.582e-6■■□□□ 13.4
WDR43Q15061 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.522e-6■■□□□ 13.4
WDR43Q15061 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.392e-6■■□□□ 13.4
WDR43Q15061 UBE2I-214ENST00000566775 396 ntTSL 310.9□□□□□ -0.662e-6■■□□□ 13.4
WDR43Q15061 FBL-210ENST00000599159 1400 ntTSL 1 (best)29.37■■■□□ 2.292e-6■■□□□ 13.4
WDR43Q15061 FBL-203ENST00000594309 603 ntTSL 228.57■■■□□ 2.162e-6■■□□□ 13.4
WDR43Q15061 FBL-211ENST00000601274 877 ntTSL 528.57■■■□□ 2.162e-6■■□□□ 13.4
WDR43Q15061 FBL-209ENST00000599134 500 ntTSL 526.91■■□□□ 1.92e-6■■□□□ 13.4
WDR43Q15061 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.892e-6■■□□□ 13.4
WDR43Q15061 FBL-208ENST00000598417 581 ntTSL 524.58■■□□□ 1.532e-6■■□□□ 13.4
WDR43Q15061 FBL-207ENST00000597634 726 ntTSL 519.91■□□□□ 0.782e-6■■□□□ 13.4
WDR43Q15061 FBL-204ENST00000594443 805 ntTSL 316.32■□□□□ 0.22e-6■■□□□ 13.4
WDR43Q15061 FBL-206ENST00000597224 732 ntTSL 311.28□□□□□ -0.62e-6■■□□□ 13.4
WDR43Q15061 MAN2A2-221ENST00000560451 5124 ntTSL 1 (best)26.57■■□□□ 1.841e-7■■□□□ 13.3
WDR43Q15061 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.151e-7■■□□□ 13.3
WDR43Q15061 MAN2A2-202ENST00000557865 2671 ntTSL 216.99■□□□□ 0.311e-7■■□□□ 13.3
WDR43Q15061 HEXIM1-201ENST00000332499 3600 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.251e-7■■□□□ 13.3
WDR43Q15061 MAN2A2-204ENST00000558161 4918 ntTSL 1 (best)16.4■□□□□ 0.221e-7■■□□□ 13.3
WDR43Q15061 MAN2A2-201ENST00000360468 6268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.011e-7■■□□□ 13.3
WDR43Q15061 MAN2A2-230ENST00000561448 1443 ntTSL 214.79□□□□□ -0.041e-7■■□□□ 13.3
WDR43Q15061 MAN2A2-226ENST00000560926 569 ntTSL 412.34□□□□□ -0.431e-7■■□□□ 13.3
WDR43Q15061 MAN2A2-207ENST00000558374 731 ntTSL 39.58□□□□□ -0.881e-7■■□□□ 13.3
WDR43Q15061 MAN2A2-215ENST00000559704 449 ntTSL 36.02□□□□□ -1.451e-7■■□□□ 13.3
WDR43Q15061 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.398e-7■■□□□ 13.3
WDR43Q15061 PPP4C-208ENST00000564966 1122 ntTSL 233.32■■■□□ 2.921e-7■■□□□ 13.3
WDR43Q15061 PPP4C-213ENST00000568810 1080 ntTSL 232.7■■■□□ 2.831e-7■■□□□ 13.3
WDR43Q15061 PPP4C-206ENST00000563597 815 ntTSL 332.7■■■□□ 2.831e-7■■□□□ 13.3
WDR43Q15061 PPP4C-209ENST00000566749 1490 ntTSL 532.66■■■□□ 2.821e-7■■□□□ 13.3
Retrieved 100 of 3,951 protein–RNA pairs in 31.8 ms