Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNIP1Q15025 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNIP1Q15025 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNIP1Q15025 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNIP1Q15025 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNIP1Q15025 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNIP1Q15025 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNIP1Q15025 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNIP1Q15025 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNIP1Q15025 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNIP1Q15025 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNIP1Q15025 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNIP1Q15025 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TNIP1Q15025 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TNIP1Q15025 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNIP1Q15025 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNIP1Q15025 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNIP1Q15025 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNIP1Q15025 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TNIP1Q15025 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNIP1Q15025 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNIP1Q15025 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNIP1Q15025 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNIP1Q15025 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNIP1Q15025 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNIP1Q15025 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNIP1Q15025 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNIP1Q15025 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNIP1Q15025 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNIP1Q15025 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNIP1Q15025 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNIP1Q15025 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNIP1Q15025 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNIP1Q15025 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNIP1Q15025 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNIP1Q15025 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNIP1Q15025 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNIP1Q15025 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TNIP1Q15025 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNIP1Q15025 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TNIP1Q15025 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNIP1Q15025 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNIP1Q15025 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNIP1Q15025 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TNIP1Q15025 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNIP1Q15025 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNIP1Q15025 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNIP1Q15025 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNIP1Q15025 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNIP1Q15025 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNIP1Q15025 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNIP1Q15025 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNIP1Q15025 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
TNIP1Q15025 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
TNIP1Q15025 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNIP1Q15025 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNIP1Q15025 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNIP1Q15025 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNIP1Q15025 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNIP1Q15025 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNIP1Q15025 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNIP1Q15025 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNIP1Q15025 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TNIP1Q15025 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNIP1Q15025 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNIP1Q15025 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNIP1Q15025 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNIP1Q15025 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNIP1Q15025 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNIP1Q15025 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNIP1Q15025 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNIP1Q15025 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNIP1Q15025 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNIP1Q15025 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNIP1Q15025 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNIP1Q15025 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNIP1Q15025 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNIP1Q15025 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNIP1Q15025 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TNIP1Q15025 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNIP1Q15025 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNIP1Q15025 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNIP1Q15025 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNIP1Q15025 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNIP1Q15025 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNIP1Q15025 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TNIP1Q15025 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNIP1Q15025 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNIP1Q15025 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNIP1Q15025 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNIP1Q15025 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNIP1Q15025 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNIP1Q15025 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TNIP1Q15025 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNIP1Q15025 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TNIP1Q15025 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNIP1Q15025 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TNIP1Q15025 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNIP1Q15025 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNIP1Q15025 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
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