Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PSME4Q14997 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PSME4Q14997 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PSME4Q14997 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSME4Q14997 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSME4Q14997 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSME4Q14997 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSME4Q14997 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSME4Q14997 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSME4Q14997 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSME4Q14997 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PSME4Q14997 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSME4Q14997 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSME4Q14997 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSME4Q14997 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSME4Q14997 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSME4Q14997 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSME4Q14997 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSME4Q14997 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSME4Q14997 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSME4Q14997 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSME4Q14997 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSME4Q14997 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PSME4Q14997 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSME4Q14997 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSME4Q14997 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSME4Q14997 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSME4Q14997 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSME4Q14997 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSME4Q14997 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSME4Q14997 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSME4Q14997 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSME4Q14997 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSME4Q14997 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSME4Q14997 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSME4Q14997 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PSME4Q14997 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSME4Q14997 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSME4Q14997 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSME4Q14997 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSME4Q14997 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PSME4Q14997 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSME4Q14997 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSME4Q14997 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PSME4Q14997 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSME4Q14997 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PSME4Q14997 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSME4Q14997 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSME4Q14997 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSME4Q14997 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSME4Q14997 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PSME4Q14997 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSME4Q14997 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSME4Q14997 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSME4Q14997 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSME4Q14997 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSME4Q14997 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSME4Q14997 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PSME4Q14997 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PSME4Q14997 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PSME4Q14997 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PSME4Q14997 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSME4Q14997 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSME4Q14997 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSME4Q14997 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSME4Q14997 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PSME4Q14997 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSME4Q14997 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSME4Q14997 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PSME4Q14997 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSME4Q14997 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSME4Q14997 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSME4Q14997 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSME4Q14997 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSME4Q14997 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSME4Q14997 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSME4Q14997 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSME4Q14997 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSME4Q14997 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSME4Q14997 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSME4Q14997 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PSME4Q14997 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSME4Q14997 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSME4Q14997 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSME4Q14997 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSME4Q14997 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSME4Q14997 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSME4Q14997 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PSME4Q14997 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSME4Q14997 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSME4Q14997 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSME4Q14997 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PSME4Q14997 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PSME4Q14997 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PSME4Q14997 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PSME4Q14997 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PSME4Q14997 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PSME4Q14997 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PSME4Q14997 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PSME4Q14997 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms