Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RFTN1Q14699 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RFTN1Q14699 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RFTN1Q14699 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RFTN1Q14699 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RFTN1Q14699 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RFTN1Q14699 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RFTN1Q14699 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RFTN1Q14699 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFTN1Q14699 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFTN1Q14699 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RFTN1Q14699 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFTN1Q14699 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFTN1Q14699 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFTN1Q14699 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RFTN1Q14699 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RFTN1Q14699 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RFTN1Q14699 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RFTN1Q14699 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RFTN1Q14699 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RFTN1Q14699 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RFTN1Q14699 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RFTN1Q14699 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RFTN1Q14699 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RFTN1Q14699 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RFTN1Q14699 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RFTN1Q14699 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RFTN1Q14699 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RFTN1Q14699 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RFTN1Q14699 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RFTN1Q14699 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RFTN1Q14699 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RFTN1Q14699 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RFTN1Q14699 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RFTN1Q14699 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RFTN1Q14699 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RFTN1Q14699 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RFTN1Q14699 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RFTN1Q14699 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RFTN1Q14699 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RFTN1Q14699 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RFTN1Q14699 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RFTN1Q14699 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RFTN1Q14699 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RFTN1Q14699 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RFTN1Q14699 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RFTN1Q14699 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RFTN1Q14699 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RFTN1Q14699 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RFTN1Q14699 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFTN1Q14699 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFTN1Q14699 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFTN1Q14699 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFTN1Q14699 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFTN1Q14699 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFTN1Q14699 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFTN1Q14699 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFTN1Q14699 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RFTN1Q14699 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RFTN1Q14699 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RFTN1Q14699 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RFTN1Q14699 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFTN1Q14699 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFTN1Q14699 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFTN1Q14699 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFTN1Q14699 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFTN1Q14699 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RFTN1Q14699 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFTN1Q14699 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFTN1Q14699 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFTN1Q14699 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFTN1Q14699 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFTN1Q14699 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFTN1Q14699 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFTN1Q14699 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFTN1Q14699 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFTN1Q14699 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFTN1Q14699 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RFTN1Q14699 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFTN1Q14699 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFTN1Q14699 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFTN1Q14699 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFTN1Q14699 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFTN1Q14699 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFTN1Q14699 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFTN1Q14699 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFTN1Q14699 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFTN1Q14699 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFTN1Q14699 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFTN1Q14699 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFTN1Q14699 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFTN1Q14699 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFTN1Q14699 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFTN1Q14699 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFTN1Q14699 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFTN1Q14699 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFTN1Q14699 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFTN1Q14699 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFTN1Q14699 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFTN1Q14699 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
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