Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEDD9Q14511 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEDD9Q14511 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NEDD9Q14511 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
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