Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEDD9Q14511 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEDD9Q14511 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NEDD9Q14511 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEDD9Q14511 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEDD9Q14511 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms