Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE1CQ14123 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PDE1CQ14123 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE1CQ14123 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE1CQ14123 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE1CQ14123 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE1CQ14123 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE1CQ14123 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE1CQ14123 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE1CQ14123 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE1CQ14123 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE1CQ14123 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE1CQ14123 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE1CQ14123 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE1CQ14123 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE1CQ14123 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE1CQ14123 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE1CQ14123 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE1CQ14123 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE1CQ14123 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE1CQ14123 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE1CQ14123 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE1CQ14123 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE1CQ14123 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE1CQ14123 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE1CQ14123 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE1CQ14123 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE1CQ14123 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE1CQ14123 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE1CQ14123 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE1CQ14123 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE1CQ14123 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE1CQ14123 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE1CQ14123 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE1CQ14123 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE1CQ14123 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE1CQ14123 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE1CQ14123 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE1CQ14123 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE1CQ14123 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE1CQ14123 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE1CQ14123 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE1CQ14123 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE1CQ14123 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE1CQ14123 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE1CQ14123 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE1CQ14123 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE1CQ14123 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE1CQ14123 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE1CQ14123 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE1CQ14123 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE1CQ14123 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE1CQ14123 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE1CQ14123 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE1CQ14123 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE1CQ14123 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE1CQ14123 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE1CQ14123 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE1CQ14123 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE1CQ14123 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE1CQ14123 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE1CQ14123 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE1CQ14123 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE1CQ14123 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE1CQ14123 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE1CQ14123 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE1CQ14123 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE1CQ14123 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE1CQ14123 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE1CQ14123 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE1CQ14123 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE1CQ14123 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE1CQ14123 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE1CQ14123 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE1CQ14123 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE1CQ14123 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE1CQ14123 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE1CQ14123 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE1CQ14123 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE1CQ14123 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE1CQ14123 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE1CQ14123 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE1CQ14123 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE1CQ14123 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE1CQ14123 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE1CQ14123 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE1CQ14123 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE1CQ14123 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE1CQ14123 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE1CQ14123 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE1CQ14123 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE1CQ14123 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE1CQ14123 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE1CQ14123 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
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