Protein–RNA interactions for Protein: Q13641

TPBG, Trophoblast glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPBGQ13641 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TPBGQ13641 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TPBGQ13641 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TPBGQ13641 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TPBGQ13641 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TPBGQ13641 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TPBGQ13641 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPBGQ13641 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPBGQ13641 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPBGQ13641 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPBGQ13641 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPBGQ13641 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPBGQ13641 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TPBGQ13641 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPBGQ13641 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPBGQ13641 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPBGQ13641 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPBGQ13641 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPBGQ13641 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPBGQ13641 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPBGQ13641 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPBGQ13641 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPBGQ13641 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPBGQ13641 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPBGQ13641 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPBGQ13641 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPBGQ13641 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPBGQ13641 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPBGQ13641 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPBGQ13641 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPBGQ13641 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPBGQ13641 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPBGQ13641 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TPBGQ13641 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPBGQ13641 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPBGQ13641 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPBGQ13641 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPBGQ13641 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPBGQ13641 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPBGQ13641 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPBGQ13641 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPBGQ13641 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPBGQ13641 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPBGQ13641 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPBGQ13641 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPBGQ13641 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPBGQ13641 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPBGQ13641 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPBGQ13641 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPBGQ13641 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
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