Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PKD2Q13563 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PKD2Q13563 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PKD2Q13563 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PKD2Q13563 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PKD2Q13563 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PKD2Q13563 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PKD2Q13563 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PKD2Q13563 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PKD2Q13563 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PKD2Q13563 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PKD2Q13563 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PKD2Q13563 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PKD2Q13563 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
PKD2Q13563 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PKD2Q13563 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PKD2Q13563 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PKD2Q13563 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PKD2Q13563 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PKD2Q13563 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PKD2Q13563 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PKD2Q13563 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
PKD2Q13563 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PKD2Q13563 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PKD2Q13563 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PKD2Q13563 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PKD2Q13563 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PKD2Q13563 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PKD2Q13563 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PKD2Q13563 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PKD2Q13563 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PKD2Q13563 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
PKD2Q13563 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.15
PKD2Q13563 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
PKD2Q13563 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
PKD2Q13563 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PKD2Q13563 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
PKD2Q13563 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PKD2Q13563 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PKD2Q13563 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PKD2Q13563 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PKD2Q13563 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
PKD2Q13563 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
PKD2Q13563 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
PKD2Q13563 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PKD2Q13563 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PKD2Q13563 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PKD2Q13563 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PKD2Q13563 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PKD2Q13563 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PKD2Q13563 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PKD2Q13563 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PKD2Q13563 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PKD2Q13563 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PKD2Q13563 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PKD2Q13563 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PKD2Q13563 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PKD2Q13563 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PKD2Q13563 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PKD2Q13563 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PKD2Q13563 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PKD2Q13563 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PKD2Q13563 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PKD2Q13563 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PKD2Q13563 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PKD2Q13563 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PKD2Q13563 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PKD2Q13563 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PKD2Q13563 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PKD2Q13563 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PKD2Q13563 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
PKD2Q13563 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PKD2Q13563 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
PKD2Q13563 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PKD2Q13563 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
PKD2Q13563 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PKD2Q13563 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PKD2Q13563 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PKD2Q13563 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PKD2Q13563 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
PKD2Q13563 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PKD2Q13563 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PKD2Q13563 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PKD2Q13563 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PKD2Q13563 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PKD2Q13563 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PKD2Q13563 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PKD2Q13563 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
PKD2Q13563 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PKD2Q13563 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PKD2Q13563 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PKD2Q13563 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PKD2Q13563 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PKD2Q13563 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PKD2Q13563 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PKD2Q13563 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PKD2Q13563 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PKD2Q13563 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PKD2Q13563 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
PKD2Q13563 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
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